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T42G病毒為本實驗室在1987年鹿谷養鱒場發生大量鱒魚死亡時,由其病魚體所分離 到的一種具兩段雙股核醣核酸病毒,在分類上屬於Birnaviridae,為感染性胰臟壞 ▔▔▔▔▔▔ 死病毒(infectious pancreatic necrosis virus, 簡稱IPNV)之VR-299電泳型。 其基因體大小為A段3.8kb 及B段3.2kb ,分別轉譯四個病毒蛋白(A段)及核醣 核酸轉錄酵素(RNA transcriptase) (B段)。本實驗 T42G 病毒的 cDNA 是利用 hexanucleotide當作random primer 或用專一性引導子(specific primers)及反轉 錄酵素(reverse transcriptase) 來合成的,雙股核醣核酸的第一階段變性條件, 以處理一次所合成之cDNA的產率優於處理兩次者,且當引導子與核醣核酸模板之用 量比例由0.5:1 提高至1:1 時,所合成之cDNA的分子變大。針對殼蛋白所設計的四 個專一性引導子,各別使用來合成T42G cDNA ,由結果顯示,A、B兩個專一性引 導子與T42G核醣核酸模板anneal情形較差,C、D兩組合成cDNA之分子較大,可達 2.0kb ,且D之專一性引導子合成cDNA量最多。此合成之cDNA連接於pGEM7zf(-)之 EcoRI 位置,再轉形(transform) 至大腸桿菌JM109 中。利用EcoRI切割及DNA dot hybridization 分析不具β-半乳糖分解酵素(β-galactosidase)活性的選殖株, 顯示共有13株來自於A段基因體及1株來自於B段基因體,其大小在A株群為0.2 至0.8kb,在B株則為0.3kb。其彼此間之重疊關係經過交叉交(cross hybridizat- ion)實驗後得知,八個較大的A選殖株clone7, 53, 1, 33, 90, 94, 97, 100插入 DNA 的兩端已被定序出來,並已找出其在基因體上的位置,但由於插入DNA 可能存 在有難以變性的二級結構,所以目前仍無法將插入DNA 的全長序列均讀出,現正以 傳代無性繁殖系(subclones) 的方法改善此一缺失。
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