中文部份：
1.溫清光、范正成、張尊國、鄭克聲、林鎮洋（2000），『流域集水區非點源最佳管理措施之研究』，行政院環保署委託專案研究計畫。
2.歐陽嶠輝，『淡水河水系水污染調查及河川自淨能力之研究』。
3.歐陽喬暉（1997），『廢水氮、磷之生物處理技術』，工業污染防治第62期，P100~P132。
4.許銘熙、連上堯，『基隆河水質之動態模擬』。
5.許銘熙、柳文成、郭義雄、郭振泰（1998），『淡水河河口環流特性之研究』，台灣水利第46卷第1期，P33~P42。
6.許銘熙、柳文成、郭義雄、郭振泰（1990），『密度變化對河口環流、鹽份分佈與水質之影響』，農業工程學報第45卷第1期，P1~P12。7.許銘熙、柳文成、郭義雄、吳啟瑞、王琪芳（2003），『利用數值模式探討淡水河系感潮段之水理特性』，台灣水利第51卷第1期，P1~P8。
8.許銘熙、柳文成、郭義雄（2001），『應用多步分解計算法於水質動態傳輸模式之研究』，台灣水利第49卷第2期，P1~P8。
9.郭振泰、郭文健（1998），『高屏溪東港溪污染量調查及整治規畫之高屏溪總量管制』，行政院環保署委託執行研究專案，EPA-87-G105-03-03。
10.柳文成（2005），『從水質模式談污染控制』，水與綠永續工程期刊第256期，P28~P36。
11.許銘熙、柳文成、吳啟瑞、謝文雄（2005），『基隆河底泥耗氧之研究』，台灣水利，第53巻第2期，P13~P20。
12.柳文成、謝文雄、吳瑞賢（2004），『水庫水位激烈變化下之水理水質模擬』，台灣水利，第52巻第3期，P60~P77。
13.許銘熙、柳文成、張勝騰、吳啟瑞、謝文雄（2004），『淡水河河口鹽度與懸浮細泥之時空變化』，台灣水利，第52巻第3期，P16~P31。
14.郭振泰、楊智傑、陳彥璋（2004），『以類神經網路預測淡水河河口之潮位』，台灣水利，第52巻第4期，P24~30。
15.李鴻源、洪佐承、林永峻、林穎典（2002），『網路型感潮河川之水質模擬』，中國土木工程學刊，第14巻第1期，P79~P91。
16.莊德豐（2004），『河川水質改善技術之探討』，美和技術學院學報，第23巻第1期，P87~P106。17.任家弘、林俊全、趙文愷、徐美玲（2004），『高屏溪流域環境水資源分佈與水質、水污染變遷之研究』，地理學報，第37期，P139~P160。18.鄭仙偉、劉文聖、李土勲（2004），『推求河川一維延散係數之演算法』，中國土木水利工程學刊，第16巻第4期，P709~P714。
19.柯志昌、吳濟華、屠益民（2004），『高屏溪流域水資源管理系統動力學模型建立與政策模擬分析』，都市計畫，第三十一巻第二期，P167~194。
20.朱啟勲，『感潮河川之水理』，台灣省台北地區防洪治本計畫。
21.霍雨時，『河川系統水力特性之分析』。
22.莊漢章，『潮汐調合分析法』。
23.陳函馨（2002），『以系統動力學建立感潮河川水理水質模式』，國立中山大學海洋環境及工程研究所碩士論文。24.吳芳池（2003），『河川流域管理－WASP水質模式評估愛河之整治方案』，國立中山大學環境工程研究所碩士論文。25.張鴻斌（2003），『高雄市都市發展與市中區水污染之系統動力學研究』，國立中山大學公共事務管理研究所碩士論文。26.李明益（2001），『河川流域水管理系統動力學模式之發展建立』，國立中央大學環境工程研究所碩士論文。27.蔡致維（2004），『愛河之水文研究』，國立中山大學海洋資源研究所碩士論文。28.洪豐偉（2004），『系統動力學為基礎之決策支援系統應用於墾丁南灣海洋海岸地區整進管理之研究』，國立中山大學海洋環境及工程研究所碩士論文。29.黃鈺珊（2001），『高屏溪流掝永續發展水資源政策規畫之系統動力學研究』，國立中山大學公共事務管理研究所碩士論文。英文部份
30.Annie Chapelle,1999,『Modelling nitrogen primary production and oxygen in a Mediterranean lagoon,Impact of oysters farming and inputs from the watershed』,Ecological Modelling ,vol.127,p161~181.
31.Buffoni,G. and A. Cappelletti,1999,『Oxygen dynamics in a highly trophic aquatic environment. The case of Orbetello Coastal Lagoon』,Estuarine, Coastal and Shelf Science, vol. 49,p763–774.
32.Cox, B.A.,2003,『A review of currently available in-stream water-quality models and their applicability for simulating dissolved oxygen in lowland rivers』,The Science of the Total Environment ,vol.314,p335~377.
33.Friend, P.L., M.B. Collins, P.M. Holligan,2003,『Day–night variation of intertidal flat sediment properties in relation to sediment stability』，Estuarine, Coastal and Shelf Science ,vol.58, 663~675.
34.Lane, R., Hassan S. Mashriqui , G. Paul Kemp ,John W. Day, Jason N. Day, Anna Hamilton,2003,『Potential nitrate removal from a river diversion into a Mississippi delta forested wetland Robert』,Ecological Engineering,vol.20, p237~/249.
35.Mehrzad Shams, Goodarz Ahmadi , Duane H. Smith,2002,『Computational modeling of flow and sediment transport and deposition in meandering rivers』 Advances in Water Resources ,vol.25 ,p689~699.
36.Soraya M. Patchineelama,Bjorn Kjerfveb,2003,『Suspended sediment variability on seasonal and tidal time scales in the Winyah Bay estuary South Carolina,USA』,Estuarine, Coastal and Shelf Science ,vol.59,p307~318.
37.Seok S. Park,Yumee Naa,Christopher G. Uchrin,2003,『An oxygen equivalent model for water quality dynamics in a macrophyte dominated river』,Ecological Modelling ,vol.168,p1~12
38.Wang, P. F., J. Martin , G. Morrison,1999,『Water quality and eutrophication in Tampa Bay, Florida』,Estuarine, Coastal and Shelf Science ,vol .49, p1–20.
39.Yang, M.D., R.M. Sykes, C.J. Merry ,1999,『Estimation of algal biological parameters using water uality modeling and SPOT satellite data 』,Ecological Modelling,vol.125,p1~13.
40.Zheng,L.,C. Chen, F. Y. Zhang,2004,『Development of water quality model in the Satilla River Estuary, Georgia 』，Ecological Modelling,vol. 178,p457~482.