經由限制 分析鴨種粒線體 DNA，以及利用polymerase chain reaction 來選殖序其
CDII基因，對照于鴨族譜品系，發現不論是限制 切割結果，或是COII基因的核 序
列，可將台灣常見鴨種分作兩群，兩群之間略有差異，但同群之內的不同鴨種則為完
全相同，分析兩群鴨種間的雜交子代之粒線體 DNA，發現限制 切割結果，及CDII基
因的核 序列均與母系鴨種一致，表示鴨種粒線體 DNA遵循母系遺傳方式；鴨群間CO
II核 ，胺基酸序列的相類程度分別是 91%，98% ，鴨COII基因的核 序列與它種生
物COII序更的相類程度分別是：雞 91%，蛙 69%，鼠 66－67%，牛 66－68%，人65－
67% ；鴨COII基因的蛋白鑄造區域總長為 687bp，與上下游相鄰的tRNA分別以一G，T
核 為界起始密碼是為 GUG，較為獨特，終結密碼則為 UAA；而不同鴨種間的核 序
列差異有59處，其中只有四處發生在密碼的第一位置會造成胺基酸的置換改變，並且
三處置換屬於中性更換，是由同類性質的胺基酸所取代，而剩餘之核 序列差異均屬
沉寂置換，因為都發生在密碼的第二，第三位置，不會影響密碼之解讀，不會造成胺
基酸之改變；詳細探究鴨群COII核 的59處差異，其中屬於Transition變化特性者共
有49處，約為Transversion變化者之8.8 倍，當中尤以C－T，T－C的轉換合佔Trans-
ition 之 51%；同種類鴨雙之間並未發現有多型性變化的情形；再以COII核 及胺基
酸序列作為基礎來比較物種演化上的親緣關係，可以發現粒線體 DNA之COII基因的演
化速率較核 DNA為快；以哺乳類粒線體遺傳密參與推知的鴨COII蛋白，經與人，牛，
鼠，蛙，雞等五類生物比對，發現以前所推測參與氧化選原活性中心的特定胺基酸，
仍然是高度保留，包括 Cua離子的配位胺基酸，與細胞色素 c結合的Asp，Glu，以及
傳遞電子的苯環性胺基酸等，都呈現極度保留的例證，表示其重要性。
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