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研究生:桑自剛
研究生(外文):SANG, ZI-GANG
論文名稱:利用粒線體去氧核糖核酸序列分析日本鰻之族群結構
論文名稱(外文):Use mitochondrial DNA sequences to evaluate the population structure of Japanese Eel (Anguilla japonica)
指導教授:陳哲聰陳哲聰引用關係許祖法
指導教授(外文):DHEN, ZHE-CONGXU, XU-FA
學位類別:碩士
校院名稱:國立海洋大學
系所名稱:漁業研究所
學門:農業科學學門
學類:漁業學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1992
畢業學年度:80
語文別:中文
論文頁數:55
中文關鍵詞:粒線體氧核糖核酸序列族群結構
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日本鰻(Anguilla japonica) 為降海產卵的鰻鱺科(Anguillidae) 魚類。不僅具有
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相當特殊的生活史且為台灣的首要經濟養殖魚種之一。然而由於鰻魚在降海後即不
易追蹤,而再度能被掌握時又是下一子代的鰻線因此這中間的生活史斷層至今仍所
知仍相當有限,對於這些鰻線來源也就產生了不同的說法,所以探究日本鰻族群結
構應是了解其鰻線資源生物學上的首要工作。但因其外部形態特徵在種內相當穩定
,且鰻魚在降海後追蹤不易,親魚產卵完即死亡,造成形態及標幟放流再捕的方法
無法施用於日本鰻。根據前述對日本鰻線來源之不同說法,本研究針對幾處具代表
性之地點,採集來游之日本鰻線,利用聚合連鎖反應將最有力且最適於研究種以
下階層及族群關係的遺傳標幟物(Hoelzel, 1991) -mtDNA 之D-loop至cytochrome
b 基因片斷加以增幅、定序。分析各個體間之序列差異(sequence variation),以
分子演化的角度解析日本鰻族群結構。
本研究結果顯示,日本鰻核酸序列長度除頭城一尾樣本為741 個外,餘皆為739
個,鱸鰻之序列長度則為722 個。日本鰻樣本間序列平均差異為 1﹪,而鱸鰻與日
本鰻種間平均差異達21﹪。所以由序列分析可以明顯發現種間之遺傳差異21倍於種
內之遺傳差異。在mtDNA 中cytochrome b基因氨基酸序列(amino acid sequence)
結果顯示,21尾日本鰻中18尾樣本之核酸序列完全一致,僅有3 尾有一個鹼基替
代,而鱸鰻與日本鰻共有5個鹼基替代,顯示cytochrome b變化在種間及種內均相
當保守。而tRNA-Threonine及tRNA-Proline基因所形成之二次結構中,日本鰻及鱸
鰻的22尾樣本的tRNA-Proline基因序列皆同,僅在tRNA-Threonine基因中三尾日本
鰻及一尾鱸鰻有鹼基替代情形,變異亦相當小。本研究發現D-loop之變異程度最大
且不同片段變異並非隨機分佈,主要集中在D-loop(c) 片段。
21尾鰻線計產生20種不同基因型,由檢驗日本鰻各基因型間序列距離結果顯示其差
異並無顯著不同。而漂移至不同地區之日本鰻線,其在同一採樣點內樣本之序列距
離與不同地點樣本間亦無顯著差異。在僅考慮基因型間核甘酸序列相似度的情況下
,以Bootstrap 重複取樣法所得到之日本鰻21個樣本之分子樹也發現,日本鰻基因
型中並無特別之基因型群集現象,表示它們並無特殊分別的遺傳結構。由以上分析
結果觀之,不同地區之日本鰻線應是來自於同一產卵族群。
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