木瓜酵素(papain)是由papaya提煉得到的蛋白水解酶，由於價格便宜，取得容易，再加上具有很廣泛的特異性(Specificity)，特別是對於胺基酸基質(substrate)具有比較多的選擇性(Selectivity)，因此普遍的備應用在蛋白質水解合成上。
然而，木瓜酵素不僅具有脂酶(esterase)和醯胺酶(amidase)的功能，同時也擬反應具有可以合成胜肽鍵(peptide bond)的功效。本論文以熱力學(Thermodynamic)和動力學(Kinetic)二種不同的反應型式，使用木瓜酵素來催化合成胜肽鍵，並且應用Biphase的方法來提生產率，以及探討溶劑效應(Solvent Effect)對木瓜酵素催化合成(Papain Catalylzed Synthesis)的影響。
首先，在實驗之初期利用我們實驗室精心研究的化學方法合成基質和標準物(Standard)，並以此作為酵素反應(Enzymicreaction)的鑑定依據。實驗過程中則以TLC(Thin-Layer Chromatography)、HPLC(High Performance Liquid Chromatography)追蹤反應l，並以MP.(Meltin Point)、NMR(Nuclear Magnetic Resonance)、AAA(Amino Acid Analysis)鑑定產物，最後使用再結晶(Recrystalization)或管柱層析(Column Chromatography)來作更進一步的純化。
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