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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:梁毓津
研究生(外文):Yuh-Jin Liang
論文名稱:菠菜葉綠體RNA聚合生體外轉錄終止之特性分析
論文名稱(外文):Transcription termination in vitro by chloroplast RNA polymerase
指導教授:陳良築
指導教授(外文):Liang-Jwu Chen
學位類別:碩士
校院名稱:國立中興大學
系所名稱:分子生物研究所
學門:生命科學學門
學類:生物科技學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1993
畢業學年度:81
語文別:中文
論文頁數:104
中文關鍵詞:葉綠體轉錄終止致弱子終止子酥胺酸致弱子
外文關鍵詞:chloroplasttranscription terminationattenuator
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由於構造及功能上的相近,菠菜葉綠體 RNA 聚合脢的轉錄終止特性與原
核生物 rho-independent 終止子有許多相似之處。為了對葉綠體的轉錄
終止機制有更多的了解,本實驗以生體外轉錄系統, 分二方面探討葉綠
體 RNA 聚合脢的轉錄終止特性。一、菠菜葉綠體 RNA 聚合脢對細菌致弱
子的辨認:本實驗根據已發表的幾種大腸桿菌致弱子核酸序列, 以聚合
脢連鎖反應的方法由大腸桿菌基因組中, 增殖出各種不同的致弱子核酸
片段。這些致弱子進一步構築至含有葉綠體起動子( PLs )的質體上,以
生體外轉錄的方法分析各種致弱子轉錄終止的效率。 結果顯示各種致弱
子有強弱不同的轉錄終止效率,但仍以酥胺酸致弱子的轉錄終止效率最高
。二、大腸桿菌酥胺酸致弱子下游核酸序列對轉錄終止效率之影響 :利
用葉綠體 RNA 聚合脢酥胺酸終止子刪除突變株進行生體外轉錄終止分析
的結果,發現酥胺酸終止子3′端 poly T 下游5個鹽基( CGACT )核酸
序列的組成對轉錄終止效率有重大的影響。 於是本實驗再度應用聚合脢
連鎖反應的方法,將酥胺酸 poly T 後 5個鹽基核酸序列以混合引子的
方法,造成這 5個鹽基逢機的重新排列組合,並配合生體外轉錄的分析
, 探討終止子下游核酸序列與轉錄終止效率間的關係。這部分結果顯示
在葉綠體 RNA 聚合脢轉錄下,這5個鹽基序列的重新組合的確造成轉錄
終止效率的不同,但在噬菌體 T7 RNA 聚合脢進行轉錄時, 這段終止子
下游核酸序列的變化,卻對轉錄終止效率沒有太大的影響。 綜合轉錄的
結果,發現在葉綠體 RNA 聚合脢生體外轉錄下, 具有" T8CGANN "下游
核酸序列的酥胺酸終止子突變株,有較高的轉錄終止效率。 進一步的分
析顯示" T8CGANN "序列中的"G"鹽基,可能帶有終止轉錄反應的重要訊
息。 綜合這些結果並參考相關的文獻,目前認為這段終止子下游的核酸
序列,可能與 RNA 聚合脢在轉錄終止發生時的轉位 (translocation)反
應有關。但確實的影響機制仍待多方面的分析與試驗。
Spinach chloroplast RNA polymerase from crude lysates was
able to recognize bacterial histidine and threonineterminators.
To determine whether chloroplast RNA polymerase would terminate
other baterial terminators invitro,several terminators isolated
from the attenuators of E.coli amino acid operons, such as leu,
trp, ilvGEDA, phe and ilvB, were transcribed by spinach
chloroplast RNA polymerase and T7 RNA polymerase. The
termination efficiency of each terminater was quantitated with
laser densitometry. Transcription results reveal that the
chloroplast and T7 RNA polymerases did terminate transcription
at different terminators with varying efficiencies. The thr
terminator wass till observed as the most efficient terminator.
Previous studies with thr terminator mutants indicatedthat the
transcription termination efficiency of thrterminator by
spinach chloroplast RNA polymerase was modulated by a not-yet-
transcribed 5 bases ( CGACT ) DNA sequences. These 5 bases are
located immediately from the termination release site. To
further characterize the effect of these 5bases on termination,
a series of systematic mutants for these 5 bases were created
by PCR with a mixed primer. These thr variants were then
transcribed in vitro by chloroplast or T7 RNA polymerase.
Transcription by chloroplast RNA polymerase indicated that the
second base of these 5 bases is important for determining the
terminationefficiency.However, the transcription termination by
T7 RNA polymerase did not reveal any difference among these
mutants.These results suggested that the termination process of
chloroplast RNA polymerase is complex and differs from T7 RNA
polymerase.
QRCODE
 
 
 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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