本試驗之目的,在於建立DNA指紋分析技術,進而將DNA指紋分析技 術應用在動物遺傳育種之研究上。試驗分兩階段進行,第一階段探討如何 建立DNA指紋圖譜,項目包括探針的來源、DNA品質狀況及使用量、 限制 的選擇、電泳條件、膠體原位雜交及南方吸漬雜交技術;試驗的第 二階段,為利用DNA指紋圖譜技術,進行動物DNA指紋分析。 在雞 方面,包括中興大學畜產系育成之B、D、L2、S系土雞, 飼養之商用 土雞及愛拔益加白肉雞。 鳥類方面,包括帝雉、藍腹鷳、台灣環頸雉、 白色鴿及雜色鴿。豬方面,包括三品種肉豬及二品種全同胞。DNA指紋 圖譜建立之研究結果顯示, 針pUCJ可供豬DNA指紋分析之用;鳥類可 利用簡單重複序列寡核 酸探針(TG)及 (GTG) ,順利建立DNA指紋圖 譜,並產生數十條多態性環帶。在DNA品質及用量方面 ,DNA的純 度要高, DNA量以10 - 15μg最適當。限制 的選擇應與探針配合, 經試驗證明, 使用探針 pUCJ、 (TG) 和(GTG) 限制 HaeⅢ、HinfⅠ 為最佳選擇。膠體原位雜交的效果優於南方吸漬雜交,此外, 膠體原位 雜交具有快速、簡便、花費少之特點。經限制 HaeIII切割之雞及豬基因 組DNA, 以探針PUCJ及(TG)進行DNA指紋分析之研究, 結果顯示 B、D、L2、S系土雞之平均環帶頻率為0.37、0.347、0.354及0.39; 共有環帶頻率之平均值為0.406、 0.350、0.36及0.416。愛拔益加白肉雞 及商用土雞平均環帶頻率為0.424及0.585;共有環帶頻率之平均值為 0.385 及 0.657, 此意味著B、D、L2、S 四系土雞之間純合度近似 , 但以S系土雞純合度較高; 又愛拔益加白肉雞及近親配種之商用土 雞, 平均環帶頻率均高於B、D、L2、S 系土雞。 二品種全同胞豬 平均環帶頻率高於逢機取樣之三品種肉豬。 鳥類基因DNA經限制 HinfI 切割,以探針(TG) 進行DNA指紋分析之研究,結果顯示台灣本 土種之帝雉、藍腹鷳及台灣環頸雉,平均環帶頻率為0.383、0.666 及0.657;共有環帶頻率之平均值則為0.424、 0.5及0.48。此意味瀕臨絕 種之稀有鳥類近親程度高,尤以藍腹鷳為甚。白色鴿及雜色鴿平均環帶頻 率為0.41及0.35;共有環帶頻率之平均值為 0.36及0.307。顯示白色鴿群 之近親程度高於雜色鴿群。DNA指紋分析除了提供品系純合度之訊息外 ,探針(TG) 在愛拔益加白肉雞母雞顯示出性別專一性; 另外, 由平均 對偶基因頻率可推測親屬關係;而共有環帶頻率之平均值可做為個體識別 之用。
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