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Alcaligenes eutrophus 為一革蘭氏陰性兼性化學自營菌, 可氧化氫氣產 生能量, 用以固定二氧化碳。氫氣的氧化由可溶性解過氧化氫( soluble hydrogenase, Hos)及粒狀解過氧化氫(particular hydrogenase, Hop) 兩種酵素催化。這兩種解過氧化氫的基因皆位於一 稱之為Hup的質體上。以轉位子Tn5對A. eutrophus野生種H1進行突變實驗 後, 發現了一種不尋常的遺傳現象,顯示有一些突變株(例如 WW1-11, WW1-12)的Hup質體在相同的區域發生了刪除。同樣的刪除現象也在一株以 mitomycin C 處理後產生的突變株H1-4中觀察到。將H1 Hup質體上相對於 質體刪除株H1-4及WW1-12中被刪除的DNA片段, 命名為D-區域, 我們利用 genomic walking的方法,由H1基因體庫(genomic library)中將D-區域DNA 逐步篩選出來。根據genomic walking的結果,估計二刪除株中被刪除的連 續DNA片段大小約為100kb。南方雜合及 DNA序列分析結果指出, 有許多組 重複序列存在D-區域及其兩側DNA片段內。D-區域兩端刪除接合點則位於 一組同向重複序列之內。
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