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研究生:黃崇勇
研究生(外文):C.Y. Huang
論文名稱:RAPD片段在變葉木型種關係上的探討
論文名稱(外文):Using the RAPD (Random Amplified Polymorphic DNAs)in the Study of the Forma Relationship in Codiaeum variegatum ( Linn. ) Blume
指導教授:陳擎霞 藍清隆
指導教授(外文):C.H. Chen C.L. Lan
學位類別:碩士
校院名稱:輔仁大學
系所名稱:生物學研究所
學門:生命科學學門
學類:生物學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1995
畢業學年度:83
語文別:中文
論文頁數:71
中文關鍵詞:逢機複製多形性核甘酸片段變葉木園藝品種形種關係RAPD 式聚合 鍊合反應
外文關鍵詞:RAPDCodiaeum variegatum (Linn.) Blumehorticultural cultivar
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本研究採用大戟科 (Euphorbiaceae) 變葉木屬中的變葉木 (C.
variegatum ) 的五品種 (form) 總計八園藝品種 (horticultural
cultivar),研究 RAPD (random amplified polymophic DNA) 片段在變
葉木類緣關係研究上的適用性。 研究中使用低與高不同要求的兩階段
PCR (polymerase chain reaction) 循環複製 RAPD 片段。 為配合
RAPD 片段使用引子附加此片段分子量的命名方式, 並設計出簡易的分子
量計算程式 Molewt ver. 1.21) 以達大量計算 RAPD 片段分子量的目的
。 最後使用由澳大利亞國立大學( Australian National University
)所得到具有十八種類緣關係計算公式的 RAPDistance 程式建立本研究
中研究材料的類緣關係。本研究中總共使用十個引子來放大此八個園藝品
種的基因組 DNA,引子所複製的片段由 15 至 28 個之間。 由此八個品
種中建立的 RAPD 片段總共 194 個,其中為所有八個品種所共有段的片
段只有 OPH5-1078,每個個園藝品種以此十個引子可產生 66.25 條
RAPD 片段,這些片段的種以此十每個引子可產生 66.25 條 RAPD 片段,
這些片段的園藝品種以此十個引子可產生 66.25 條 RAPD 片段,
這些片段的料所建立的類緣關係經 RAPDisatnce 程式分析結果,所得十
八個關係圖主要有五組。 此五組關係圖經判別後發現共有三組品種的類
緣關係被程式確認重複出現, 此三組關係為( 1 ) cv. Interruptum
(飛燕)與 Aureo-Macultaum. (星鱉甲)與 Caribbean Star. (龜甲
黃)被歸為一群;( 2 ) Spriale (嫦娥綾)與 Evening Embers (漁
火)被歸於一群; ( 3 ) Van Oosterzeei(鹿子斑)與 Graciosum (
柳長)同被歸於一群。並且其中有兩組符合本研究中所已知其性狀特徵歸
類的組別;這兩組分別為( 1 ) Aureo M. (星鱉甲)與
Caribbean S. (龜甲黃)同為闊葉變葉木 (forma
platyphyllum);( 2 ) Van O. (鹿子斑)與 Graciosum (柳長)同
為細葉變葉木 (forma taeniosum)。
This report is to investigate the potential of using RAPD
(random amplified polymorphic DNA) to study the
phylogenetic relationship of 8 horticultural cultivators
belonging to 5 forms in Codiacum variegatum (L.) Jussieu
(Euphorbiaceae). In the PCR (polymerase chain reaction), low
stringency condition was used in the first 5 cycles and high
stringency conduction was used in the subsequent 40 cycles. A
BASIC program (Molewt ver 1.21) was written to calculate
the molecular weight of each RAPD fragment. Each RAPD
fragment was then identified with a compound name
comparising of a primer''''s name and its size. Finally,
the RAPDistance package obtained from the Australian
National University was employed to establish the
phylogenetic relationship, Ten 10-bp random primers with
%GC of 60-70 were used. Fifteen to twenty-eight RAPDs could
be generated from the genomic DNA templates of 8 cultivators
using a single primer. Totally, 194 RAPDs were identified.
However, only OPH5-1078 was shared by all cultivars. On
average, 66.25 RAPDs were identifiable for each cultivator.
Five types could be recognized from the 18 dendograms
established by the "RAPDistance". Furthermore, cv.
"Interruptum", "Aureo-maculatum" and "Caribbean Star",
"Spriale" and "Evening Embers" and "Graciosum" and "Van
Oosterzeei" were grouped to a same tree, respectively. This
result was congruent with the previous classification
based on morphology that grouping "Aureo-maculatum" and
Caribbean Star" as forma platyphyllum and "Van Oosterzeei" and
Graciosum" as forma taeniosum,
QRCODE
 
 
 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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