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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:鄒孟甫
研究生(外文):Tzou, Mang-Fu
論文名稱:鏈黴菌S.lividansZX7線狀染色體末端結構及複製
論文名稱(外文):Studies on the terminal structure and terminal replication of the linear chromosome in Streptomyces lividans ZX7
指導教授:陳文盛陳文盛引用關係
指導教授(外文):Carton W. Chen
學位類別:碩士
校院名稱:國立陽明大學
系所名稱:遺傳學研究所
學門:生命科學學門
學類:生物訊息學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1995
畢業學年度:83
語文別:中文
中文關鍵詞:線狀染色體雙向膠體電泳法鏈黴菌
外文關鍵詞:Streptomyces lividanslinear chromosome
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鏈黴菌Streptomyces lividans ,具有一條8Mb 長的線狀染色體,末端有蛋白質共
價附著在DNA-5'端,並含一30Kb長的末端顛倒重複序列。在30kb的顛倒重複中,最
末端的15.5kb與S. lividans 一線狀質體SLP2的一端無法區分,本論文針對此15.5
kb中最靠近末端的10.1kb序列進行定序( 剩餘的5.4kb 序列則是先前已定序完成的
轉位子Tn4811 )希望能了解S.lividans,染色體末端DNA 的結構以及它可能扮演的
角色。
定字的結果,共得到10113 bp新的序列,序列內僅含一個較符合鏈黴菌基因codon
usage 的open reading frame(ORF) ,命名為PRF1。此ORF1可產生一630 個氨基酸
的蛋白質,pI值為11,但在蛋白質序列庫中,並無找到任何與之相似的蛋白質。此
10.1kb序列G+C%含量為67.7% ( 略低於一般Sfreptomyces的乎均: 70-75%) ,同一
股序列中,整體嘌呤與嘧啶的比例大致相近,但在區域分析中發現接近Tn4811序列
的1kb 區域裡正股的G 核甘酸( 反股的c ) 分佈異常的高,特別有高密度的GGCGG(
反股CCGCC ) 的重複序列( 包佔此序列所有GGCGG 的一半 )。
雙核甘酸(dinuclcotde) 及參核甘酸(trinucleotide) 頻率在此10.1kb序列的分佈
也與Tn4811的分布有明顯的不同。顛倒重複(invcrted repcats)的分佈頻率在末端
特別高( 最末端的240bp 中出現了12個 ),可能是蛋白質附著辨認的序列。綜合來
看此10.1kb的部分序列,可能是扮演結構上的功能,因而缺乏編碼序列,不是無意
義的任意序列。
另外本論文也同時利用雙向膠體電泳法分析S. lividans 染色體最末端2.5kb DNA
的複製行為,發現此2.5 kb DNA以數種不同形態分佈,這些不同形態的分子可能是
正在進行DNA 複製中的過渡產物。我們提出了一個初步的模型,認為在此2.5kb 區
域中,存在複製停止及暫停的地方,阻擋從oriC來的lagging strand的複製,留下
的3'股則借由末端蛋白質當引子,從末端進行之DNA 複製與其交會。這個模型還需
進一步的實驗驗證。

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