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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:邱秀英
研究生(外文):Chiou, Shiow-Ying
論文名稱:Cytophagasp.生產生澱粉水解�@條件之探討Cytophagasp.之S-layer蛋白質基因選殖與定序
論文名稱(外文):Facters affecting the production of raw-starch-digesting amylase of Cytophaga sp.. Cloning and sequencing of S-layer protein gene from Cytophaga sp.
指導教授:蔣啟玲蔣啟玲引用關係
指導教授(外文):Chii-Ling Jeang
學位類別:博士
校院名稱:國立中興大學
系所名稱:食品科學系
學門:農業科學學門
學類:食品科學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1997
畢業學年度:85
語文別:中文
論文頁數:160
中文關鍵詞:生澱粉水解選殖逆向聚合 鏈反應
外文關鍵詞:S-layer蛋白質raw starch digesting amylaseS-layer proteincloninginverse PCR
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第一章Cytophaga sp. 生產生澱粉水解條件之探討摘要本研究室由土壤
分離出一株革蘭氏陰性桿菌,鑑定為Cytophaga sp.。該菌所產生的澱粉
,可分解生澱粉與糊化澱粉,本文主要探討培養條件與培養基組成份,
對Cytophaga sp. 產生澱粉的影響。基礎培養基是由1 % polypeptone
、0.2 % yeast extract、0.5 % beef extract與0.5 % 乾熱殺菌的玉米
澱粉組成。在37℃ 下,以100 rpm振盪培養24小時,產生生澱粉水解活
性為 30.0 U/ml。當降低培養基中玉米澱粉的添加量,或氮源
polypeptone改用大豆分解的polypeptone-S、脫脂大豆代替, 皆可提高
生澱粉的產量。最適培養基的組成份為0.5 % polypeptone-S、 0.2 %
yeast extract與0.2 % 生玉米澱粉, 培養基pH 為6.5。利用此培養基,
在35℃下,以100 rpm 進行振盪培養24小時,所產生生澱粉水解活性
為220 U/ml,酵素產量較使用基礎培養基時提高7倍之多。Cytophaga sp.
之S-layer蛋白質基因選殖與定序摘要 在Cytophaga sp. 菌體及培養
液中發現一主要蛋白質,分子大小經SDS-PAGE估計為120 kDa,由雙向電
泳估算此120 kDa蛋白質約占菌體總蛋白質16 %。Cytophaga sp. 菌體
於37℃ 下,以 4M guanidine hydrochloride ( pH 7.4 ) 處理5分鐘,
可將此120 kDa蛋白質由菌體分離; 經由細胞區分結果顯示此120 kDa蛋
白位於細胞套 ( cell envelope ) 部份,由膠金免疫標幟法 ( IgG
colloidal gold labelling ) 發現此蛋白質位於菌體表面,因此,推測
此蛋白質可能是Cytophaga sp. 之S-layer蛋白質。 利用Cytophaga
sp. 之 S-layer 蛋白質製備的抗血清,以免疫轉印法自λZAP II與
Gigapack建立的Cytophaga sp. 基因庫中,篩選得正反應株。將選殖株進
行核酸的序列分析與蛋白質的分析,發現 S-layer 蛋白質內部N-端胺
基酸序列與選殖基因所轉譯之蛋白質第499到第513胺基酸殘基序列 (
MKDGSRKSFPITVTA ) 完全相同,此轉譯之蛋白質未包含S-layer 蛋白質N-
端胺基酸序列,故知選殖基因缺乏 5'' 端部份基因。利用 inverse PCR及
PCR 產物定序,完成 5'' 端不足部份的 DNA 序列分析。得到一核酸序
列可轉譯成含 1047 個胺基酸的 open reading frame ( ORF ),此蛋白
質含一段32個胺基酸的訊號胜 ( signal peptide ),自第33個胺基酸
起與 Cytophaga sp. 產生的S-layer 蛋白質N-端胺基酸序列 (
ASDATGIYKDAVNYLIEKGI ) 完全相同。推測此核酸序列應包含 Cytophag
sp. 之 S-layer 蛋白質基因完整序列。將選殖基因的胺基酸序列與資料
庫的資料進行比對,發現此蛋白質胺基酸序列與其它細菌來源的S-layer
蛋白質具有較高的相似性 ( 29-43 % )。然而此蛋白質的功能尚待更進一
步的探討。
Facters affecting the production of raw-starch-digeting amylase
of Cytophaga sp.. A Cytophaga sp. isolated from soil had a great
potential for the production of raw starch digesting amylase.
The effects of growth conditions and medium composition on
enzyme production were investigated. The basal medium contained
1 % polypeptone, 0.2 % yeast extract, 0.5 % beef extract and 0.5
% raw corn starch. Enzyme production was increased when the
contents of raw starch was reduced. Enzyme production was also
increased when polypeptone was replaced by polypeptone-S or
defatted soybean. The optimal culture medium consists of 0.5 %
polypeptone-S, 0.2 % yeast extract and 0.2 % raw corn starch at
pH 6.5. The amylase activity in the supernatant of the culture
with raw starch as the one of the carbon source reached maximal
level ( 220 U/ml ) after 24 h incubation at 35℃. Cloning and
sequencing of S-layer protein gene from Cytophaga sp.Protein
compositions of the total cell of Cytophaga sp. were analyzed by
two-dimensional gel electrophoresis. One major protein
constituted about 16 % of the protein contents of the cells as
revealed by Bioimage analysis. It had a molecule mass of 120
kDa determined by SDS-PAGE. The 120 kDa protein was removed from
the cell after treating with 4 M guanidine hydrochloride ( pH
7.4 ) at 37℃ for 5 min. There was also a leaching out of this
protein from the cell during growing. By fractionation the 120
kDa protein was shown to be located in the cell envelope. The
cell surface location of the protein was also confirmed by IgG
colloidal gold labelling of whole cells preadsorbed with 120 kDa
protein antiserum. From above results, the 120 kDa protein was
considered as an S-layer protein of Cytophaga sp..AbstractS-
layer protein is the major protein of Cytophaga sp.. Polyclonal
antibodies against purified S-layer protein were used to screen
aλZAPII library containing chromosomal Cytophaga sp. DNA.
Several phages capable of expressing this S-layer protein were
isolated from Escherichia coli. The nucleotide sequences of
positive clones were determined. The internal N-terminal amino
acid sequence of S-layer protein was consistent with the
sequence from Met-499 to Ala-513 amino acid residues (
MKDGSRKSFPITVTA ) translated from nucleotide sequence of
positive clone. The amino acid sequence of this clone does not
contain N-terminal amino acid sequence of S-layer protein. It
is suggested that the clone is a part of the S-layer protein
gene and lacked the 5'' end sequence. By the inverse PCR and PCR
sequence techniques, the complete nucleotide sequence of S-layer
protein gene was determined. It encoded a protein of 1047 amino
acids. The first 32 amino acids resembled a putative secretion
signal, giving rise to a mature S-layer protein of 1015 amino
acids. The N-terminal amino acid sequence (
ASDATGIYKDAVNYLIEKGI ) of S-layer protein was consistent with
the amino acid sequences translated from the nucleotide
sequences. Amino acid sequence alignment analysis revealed a
level simiarity of ranging from 29 % to 43 % with the S-layer
protein from other bacteria.
封面
目錄
第一章Cytophaga sp.生產生澱粉水解梅條件之探討
中文摘要
英文摘要
緒論
一、澱粉脢對澱粉顆粗的作用形態
二、生澱粉水解梅的作用機制
三、生澱粉水解梅的應用
四、研究目的
材料與方法
材料
方法
一、培養基的組成
二、菌體的培養
三、酵素分析
結果
一、培養液體積的影響
二、培養基pH的影響
三、培養溫度的影響
四、Yeast extract的影響
五、不同氮源的影響
六、不同碳源的影響
七、金屬離子的影響
八、酵素生產的最適條件
討論
參考文獻
第二章 Cytophaga sp.120kDa蛋白質之純化與分析
中文摘要
英文摘要
緒論
材料與方法
材料
一、菌種
二、培養基
三、藥品與酵素
方法
一、蛋白質的雙向電泳分離法
(一)樣品製備
(二)雙向電泳
二、Cytophaga sp.120kDa蛋白質之分離
三、120kDa蛋自質抗血清之製備
四、穿透式電顯圖樣品製備
五、細胞套(cell envelope)的分離
六、膠金免疫標幟法
結果
一、I20kDa蛋白質的分析
二、I20kDa蛋白質的分離
三、Cytophaga sp.不同生長期之電子顯微鏡觀察
四、120kDa蛋白質抗血清IgG的製備
五、120kDa蛋白質所在住置
討論
參考文獻
第三章 Cytophaga sp.之S-layer蛋白質基因選殖與定序
中文摘要
英文摘要
緒論
一、S-layer蛋白質的顯微構造
二、S-layer蛋白質之功能
三、S-layer蛋白質的應用
四、研究目的
材料與方法
材料
一、菌種
二、酵素
三、藥品
方法
一、Cytophaga sp.基因庫(genomic libray)的建立
(一)染色體DNA的純化
(二)入 ZAPII為載體之接合作用
(三)寄主細菌之培養與預處理
(四)生體外噬菌體包裝法
二、S-layer蛋白質基因之選殖
(一)溶菌斑之製備與轉印
(二)S-1yaer蛋白質抗血清的製備
(三)表現S-1ayer蛋白質溶菌斑之篩選
(四)生體內之剪切作用(in vivo excision)
三、次選殖株之建立
(一)質體DNA的純化
(二)重組DNA的構築
(三)單向刪減DNA法
(四)轉形作用
四、選殖基因在E.coli中蛋白質的表現與偵測
(一)選殖基因在E.coli中蛋白質之誘生
(二)蛋白質電泳分析
(三)西方墨漬免疫反應分析
五、蛋白質與胜鈦片段N-端胺基酸序列分析
(一)S-layer蛋白質胜肢圖譜分析
(二)蛋白質的轉漬與胺基酸序列分析
六、DNA的定序
(一)選殖株質體DNA的定序
(二)PCR產物的定序
七、南方轉印法
(一)探針(probe)的製備
(二)雜交作用(hybridization)
(三)呈色反應
八、逆向聚合梅鏈反應(inversePCR)
九、S-layer蛋白質基因的合成
結果
一、染色體基因庫(genomic library)的建立
二、Cytophaga sp.S-layer蛋白質基因的選殖
三、含Cytophaga sp.S-layer蛋自質基因正反應的鑑定
四、次選殖株的建立
五、Cytophaga sp.S-1ayer蛋自質基因核甘酸序列分析
六、表現S-1ayr蛋白質基因5''-端上游基因之定序
七、蛋白質分析
討論
參考文獻
附錄
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