莫氏樹蛙是台灣特有種，為一泛島型分布的種類；由於其活動性不強
，且有返回原產地繁殖的習性，故推測其族群的擴張受到一定程度的限制
，然而卻是台灣綠色樹蛙屬中分布最廣的一種，因此其族群散布歷程及演
化歷史是很值得探討的！本實驗應用分子生物技術來研究莫氏樹蛙各族群
間之親源關係：包括利用 PCR-RFLP（Restriction Fragment Length
Polymorphism）及定序（sequencing）分析粒線體DNA的12S rRNA-16S
rRNA片段（約1100bp）。目的為了解其族群結構及基因組成，探討族群遺
傳變異是否與地理分布有關，及中央山脈是否為其地理阻隔，進而推測出
其散布路徑及時間。在PCR-RFLP的部份，總共分析了19個族群，212隻樣
本；進行 3種限制內切酵素單酵素切的結果，共得到23個限制內切酵素片
段，可分為11種單倍基因型（haplotype）。根據族群所含基因型分布的
地點，可區分為西部＋東北部型、東北部型、東南部型、西南部型、及全
區型等五種類型，而各地區的基因組成也不盡相同；西部各族群的基因組
成都很類似，以H01型為主；東北部、東南部及南部的族群已各發展出獨
特的基因型；這顯示分布在中央山脈東西兩側的族群已經產生分化的現象
，導致基因型的組成已有所差異。此外，根據Nei and Tajima（1981）的
公式計算每個族群的基因多樣性指數，可知西部族群的基因組成較為均質
，東南部族群的基因異質性較高。對粒線體DNA的部份12S rRNA基因片段
（500 bp） 、整個tRNAVal 及部份16S rRNA基因片段（約500 bp）進行
定序，共得到37個變異位置（variable sites），以Kimura''s
2-parameter的方法計算基因型間的遺傳距離（genetic distance），以
聚類分析法（neighbor-joining）和進化最儉約分析法（maximum
parsimony analysis）建構親緣關係樹狀圖，將30隻樣本的DNA序列分成
二個主群（lineages）：第一群稱為東部系統，以中央山脈以東、富源以
南的東南部及瑪家、南仁山為主；第二群稱為西部系統，以中央山脈以西
、扇平以北的西部區域及太平山之族群構成；且兩系統間有明顯的分化現
象。族群親緣關係樹的樹型（topology）與基因型的親緣關係樹相同，可
以分為東部族群組和西部族群組，兩族群組之間的平均遺傳距離為1.39％
，且根據巢式變方分析（nested analysis），表示遺傳差異主要存在於
東西兩族群組之間。根據主成份分析所得，莫氏樹蛙的外表形質沒有分化
的現象。綜合以上結果可以得到兩個結論︰一是莫氏樹蛙可分成兩大群，
一群在東南部，另一群在西部；二是東部族群的基因歧異度大於西部的族
群。推測中央山脈可能是莫氏樹蛙族群擴散時的地理阻隔，而莫氏樹蛙族
群的分化模式，可用擴散分化（dispersal differentiation）及隔離分
化（isolation differentiation）來解釋。
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