台灣論及醫藥分業已近四十年，期間不乏多種針對醫藥分業議題所做之研究；然而，所有的研究都著墨於相關因子量化之探討，卻忽略了台灣面臨民主轉型利益團體興起所帶來的影響。
一九九七年三月一日正值醫藥分業之實施，實有必要由另一個角度對此政策加以剖析，以瞭解台灣醫藥分業政策之沿革及其爭議，並探討醫藥團體在此政策中所扮演約角色。
本研究係採質性研究法，以歷史檔案資料及深入訪談兩種方式收集資料，以增加資料之豐富性。歷史檔案以官方與非官方兩大類為主，而訪談部份則以醫藥團體之理事長或秘書長為訪談對象，關於歷史部份則採滾雪求抽樣法，共有二十七位受訪者。
根據研究分析，獲得以下之結論：
一、醫藥分業之歷史：
1．醫藥分業政策寄居於各法律條文中，造成推動上的困難。
2．由醫師法、藥事法到藥事法中相關醫藥分業之法律條文，都可見醫
藥團體運作之軌跡，而期間醫藥團體之影響互有消長。
二、專業意識型態與自主權：
藥事人員在發展成為一個專業角色之前，最大的障礙便來自於醫師，醫師雖然認同藥師是專業，然而，這樣專業角色的擴展仍必須在醫師的控制範圍內，所以，醫師仍視藥事人員為協助醫師約角色，且必須在醫師的控制下執行業務，無法將醫藥分業視為合作。
三、策略：
藥界對醫藥分業有長期之推動計畫，醫界則隨著藥界的各種行動而反制，為一種刺激的直接反應，較少見主動、積極之策略。但兩者在策略的使用上均是複雜而多元，有賴事後的建構。直至一九九六年醫界始有危機意識，加上因應健康保險而產生的各種體制外團體，醫界行動由被動轉而積極，策略的使用上以「衝突」與「遲滯」為主，並開始訴諸於群眾運動，將醫藥兩衝突推向最高點。
四、影響力：
雖然，醫藥團體主導醫藥分業政策之形成，然而在國家仍掌握行政權下，以行政裁量權擴大對醫療急迫情形之解釋；醫藥分業實質精神已蕩然無存，僅剩「落實一百零二條的實施」。