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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:黃美玉
研究生(外文):MEI-YI HUANG
論文名稱:RAPDs應用於琉球黃楊族群遺傳變異之研究
論文名稱(外文):A Study on the Population Genetic Variation of Buxus liukiuensis by the Method of RAPDs
指導教授:應紹舜應紹舜引用關係
指導教授(外文):Shao-shun Ying
學位類別:碩士
校院名稱:國立臺灣大學
系所名稱:森林學研究所
學門:農業科學學門
學類:林業學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2000
畢業學年度:88
語文別:中文
論文頁數:57
中文關鍵詞:琉球黃楊逢機擴大多形性DNAs分子標記分析技術遺傳變異
外文關鍵詞:Buxus liukiuensisRAPDsgenetic variation
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中文摘要
琉球黃楊(Buxus liuKiuensis Makino.)主要生育地為石灰岩地質,分佈地點以琉球、台灣為主。全台分佈零星且各分佈點之族群數量不多,多見散生於中、低海拔(100-1500m) 一帶山區。
本研究係採集臺灣地區8個分佈點共150單株,應用逢機擴大多型性DNA分子標記分析技術(random Amplified polymorphic DNAs, 簡稱RAPDs) 來偵測琉球黃楊(Buxus liuKiuensis Makino.)8個地理性族群之遺傳變異,使用9個逢機序列之核酸引子,擴增了97個核酸條帶,其中有92條為多形性(94.8﹪),另有8條為單形性(8.25﹪)。
根據NTSYS算出Dice相似性係數的結果,以 UPGMA方法做單株個體相似性樹形(歸群)圖。
經由POPGENE(150樣本)分子變異分析得知,琉球黃楊族群間的遺傳變異量佔變異總量36.54%(Gst);族群內的變異比例佔總變異63.46%(Gst)。從族群間的變異值顯示,這8個不同地理性族群間,只有較低基因交流,且呈現明顯分化現象。
Abstract
Buxus liukiuensis ,a rare plant of Taiwan and Lyukyus ,usually occurs at eastern and southern parts of Taiwan ,and its elevations ranges form 100 to 1,500 meters above sea level, at limestone sites:they occupy a small isolated patches mixed with other trees in forests.
This aim of this study is to research the genetic variation of Buxus liukiuensis Makino. by RAPDs analysis : a total of 150 samples of Buxus liukiuensis which are representing the populations of eight area were collected.A test of random amplified polymorphic DNA to identify its genetic variation .and Amplification with 9 primers to yield a total of 97 polymorphic RAPDs bands were recorded.Among them ,92 bands are polymorphism(94.85﹪),and 8 DNA bands are monomophism(8.25﹪).
A UPGMA cluster analysis was performed on the Dice''s similarity matrix which derives form eight populations of plants by Ntsys.
Partition the genetic variation into within and between populations of Buxus liukiuensis through POPGENE analysis indicated 36.54﹪of variation is between populations while63.46﹪of variation within population.It is suggested,based on the studies,there is not or lower gene interflow existed among populations,indicating great genetic differentiation which was mostly caused by geographical isolation occurred.
中文摘要………………………………………………………….6頁
英文摘要…………………………………………………………7頁
一、前言……………………………………………………………..….8頁
二、琉球黃楊分類地位之探討…………………………….…..9頁
三、前人研究…………………………………………………….…….11頁
(一)RAPDs分子標記分析技術特性之介紹……………………….11頁
(二)相關文獻之回顧………………….……………………………12頁
四、材料與方法………………………………………………………18頁
(一)材料來源………………………………………………………18頁
(二)儀器藥品設備…..…………………………………………..20頁
1.儀器用具…………………………………………….…….20頁
2.藥品試劑……………………………………………..…..20頁
(三)方法與步驟…………………………………………….………21頁
1.葉片DNA的萃取…………………….…………………….21頁
2.DNA的定量與稀釋…………………………………….……22頁
3.進行RAPD-PCR(polymerase chain reaction)反應…..23頁
4.電泳………………………………………………………..26頁
5.估算族群結構之分析方法……………………….………..27頁
五、試驗結果……………….………………………………….…29頁
(一)擴增條帶記錄…………….…………………………………..29頁
(二)DNA電泳圖譜…………..….………………………..………31頁
(三)琉球黃楊150個單株個體之相似性樹形圖…………………36頁
(四)POPGENE族群遺傳分析(POPULATION GENETIC ANALYSIS)…..39頁
六、討論………………………………………………………………45頁
七、結論…………………………………………….………..50頁
八、參考文獻…………………………………….…………..51頁
圖之目次
圖1、琉球黃楊之形態特徵圖………………………………………..10頁
圖2、琉球黃楊採樣位置圖…………………………….………..19頁
圖 3、以Z2引子(primer)進行琉球黃楊葉部組織RAPD試驗之電泳圖譜…31頁
圖 4、以Z3引子(primer)進行琉球黃楊葉部組織RAPD試驗之電泳圖譜….32頁
圖 5、以Z5引子(primer)進行琉球黃楊葉部組織RAPD試驗之電泳圖譜….33頁
圖 6、以Z9引子(primer)進行琉球黃楊葉部組織RAPD試驗之電泳圖譜…34頁
圖 7、以Z14引子(primer)進行琉球黃楊葉部組織RAPD試驗之電泳圖譜…35頁
圖8、琉球黃楊單株個體之相似性歸群圖…………….….…….…38頁
圖9、琉球黃楊族族間Nei''s遺傳距離之歸群分析圖(修正)…..…44頁
表之目次
表1、琉球黃楊與臺灣黃楊形態特徵之異同…………….…….….10頁
表2、琉球黃楊採集樣區之基本資料……………………………….18頁
表3、RAPD-PCR反應試劑品名及用量………………………...24頁
表4、供試引子序列及GC%……………….…………….………………25頁
表5、逢機引子(Primers)擴增之DNA片段條帶標記……….…30頁
表6、Nei’s基因歧異度分析……………………………………………..40頁
表7、Nei’s 遺傳相似度及遺傳距離…………………………………….43頁
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