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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:黃國彰
研究生(外文):Huang Kuo Chang
論文名稱:歸一化對cDNA微陣列數據分析的影響
論文名稱(外文):Data analysis for the influence of cDNA microarray normalization
指導教授:許文郁許文郁引用關係
指導教授(外文):Shu Wun Yi
學位類別:碩士
校院名稱:國立清華大學
系所名稱:統計學研究所
學門:數學及統計學門
學類:統計學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2002
畢業學年度:90
語文別:中文
論文頁數:48
中文關鍵詞:歸一化
外文關鍵詞:Normalization
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cDNA微陣列實驗數據其變異(Variation)的來源有很多,有的是實驗者真正感興趣的,有的是實驗過程中無可避免的因子造成的,實驗者對這一部份是不感興趣的。在對實驗數據作任何統計分析之前,要先想辦法把這不感興趣的部分移除,這個程序稱為「歸一化(Normalization)」。歸一化的主要目的是為了讓系統性實驗變異的影響減至最小,更容易區分出基因之間的差異性。目前「歸一化」的方法有很多,本論文主要探討如何利用「歸一化」將cDNA微陣列實驗中一些系統性實驗因子效應去除,使得後續統計分析工作更為準確。本文並以Ideker et al.(2000)的實際實驗數據,研究不同的歸一化方法,對基因表現顯著性的檢定會造成多大的差異。
目錄
摘要……………………………………………………………………………………
第一章:前言…………………………………………………………………………1
第二章:cDNA微陣列的原理與實驗流程……………………………………………3
2.1:cDNA微陣列的原理………………………………………………….3
2.2:cDNA微陣列的實驗流程……………………………………………..4
第三章:cDNA微陣列的變異來源與實驗設計………………………………………7
3.1:變異因子………………………………………………………………7
3.2:實驗設計……………………………………………………………..9
3.3:模式…………………………………………………………………..10
第四章:歸一化………………………………………………………………………13
4.1:歸一化方法………………………………………………………….13
4.2:歸一化方法的比較…………………………………………………..16
4.3:MC圖與MG圖…………………………………………………..…20
第五章:檢定…………………………………………………………………………24
5.1:檢定方法:Error Model…………………………………….………24
5.2:歸一化對檢定的影響……………………………………….………26
第六章:結論…………………………………………………………………………29
參考文獻:……………………………………………………………………………30
附錄A:……………………………………………………………………………….32
附錄B:……………………………………………………………………………….32
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