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研究生:曾貞寧
研究生(外文):Chen-Ning Tseng
論文名稱:合併染病同胞對資料其標識基因之下傳/不下傳訊息與同源全等基因訊息的連鎖分析方法
論文名稱(外文):Combining Transmission-Nontransmission Information and Identical by Descent Information for Test of Linkage in Affected Sib Pairs
指導教授:戴政戴政引用關係
指導教授(外文):Jung Tai
學位類別:碩士
校院名稱:國立臺灣大學
系所名稱:流行病學研究所
學門:醫藥衛生學門
學類:公共衛生學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2004
畢業學年度:92
語文別:中文
論文頁數:46
中文關鍵詞:染病同胞對傳遞不平衡檢定均值檢定同源全等基因數目連鎖不平衡
外文關鍵詞:IBDTDTmean testaffected sib pairslinkage disequilibrium
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對於染病同胞對(affected sib pairs)的資料進行遺傳連鎖分析,目前有兩種較常使用的無母數方法,一種是均值檢定(mean test),用於分析染病同胞對之資料,去測定標識基因下傳到染病同胞對的同源全等基因數目(IBD,identical by decent);另一種,是針對一個核心家庭具一個染病小孩所發展出來的傳遞不平衡檢定(TDT,transmission/disequilibrium test),用標識基因與疾病基因一併下傳與否現象,來檢定連鎖不平衡,傳遞不平衡檢定可推廣於染病同胞對的資料,故已有釵h研究比較均值檢定與傳遞不平衡檢定的檢定力。
均值檢定與傳遞不平衡檢定的檢定力在不同連鎖不平衡程度下,會呈現相消長的現象,即若連鎖不平衡程度弱時,均值檢定的檢定力會比傳遞不平衡檢定的檢定力好;連鎖程度強時,傳遞不平衡檢定的檢定力比均值檢定好。本論文目的在嘗試合併兩者訊息,造出一個對連鎖不平衡干擾具有強韌性的新統計量。在這個想法上,先利用均值檢定的IBD值與傳遞不平衡下傳的訊息,找出其聯合機率,並且證明了兩者並不獨立。其後,由聯合機率造出一個新的統計量,並以模擬方法比較新的統計量與均值檢定及傳遞不平衡檢定的檢定力表現。
There are two major nonparametric methods for the test of linkage.One is the mean test which is applied to affected sib pairs.The other is TDT
(transmission/disequilibrium test)which is applied to case-parent triad families and can be extended to multiple affected children.Therefore,when the data are gathered with affected sib pairs,both methods are applicable for the test of linkage.It has been known that when linkage disequilibrium is weak,the power of mean test is greater than that of TDT,but when linkage disequilibrium is strong,the power of TDT is greater than that of the mean test.In this paper,we propose a new method to combine two tests to construct a new statistic. First,we derived their joint probabilities for the transmission-nontransmission information and identical by descent information in sib pairs.We showed that the two variables representing the two types of information are dependent.Based on this joint probabilities we developed a new statistic for the test of linkage.Finally,we compared the powers of the new statistic,TDT and the mean test.
目錄

中文摘要 I
英文摘要 II
目錄 III
表目錄 V

第一章 緒論 1

1.1 遺傳統計方法的發展與文獻回顧 3
1.2 遺傳名詞解釋 4


第二章 應用方法介紹 7
2.1 傳遞不平衡檢定 7
2.1.1 每個家庭有一個染病小孩 7
2.1.2 每個家庭有兩個染病小孩 10
2.2 均值檢定 11

第三章 研究方法 13
3.1 研究動機與目的 13
3.2 符號定義 14
3.3 研究方法 14
3.3.1 聯合機率分布的計算 14
3.3.2 均值檢定與傳遞不平衡檢定轉換後的形式 35

III

3.3.3 組合均值檢定與傳遞不平衡檢定以造出新的統計量 38
3.4 資料模擬 40


第四章 結果與討論 43
4.1 模擬結果 43
4.2 討論與建議 45

參考文獻 VI
參考文獻

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