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研究生:顏家馨
研究生(外文):Chia- Hsin Yen
論文名稱:兩種用於檢定家族資料連鎖不平衡之方法
論文名稱(外文):Two approaches for test of linkage disequilibrium in pedigree data
指導教授:戴政戴政引用關係
指導教授(外文):John Jen Tai
學位類別:碩士
校院名稱:國立臺灣大學
系所名稱:流行病學研究所
學門:醫藥衛生學門
學類:公共衛生學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2004
畢業學年度:92
語文別:中文
論文頁數:41
中文關鍵詞:三元體資料家族資料PDT統計量TDT統計量連鎖不平衡
外文關鍵詞:pedigreetriadPDTlinkage disequilibriumTDT
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檢定疾病基因座與標識基因座間是否存在連鎖不平衡,可利用家庭資料或是族群資料進行分析。當二基因座間存在連鎖,利用家庭資料檢定應該會得到較高的檢定力。以家庭資料檢定連鎖不平衡從一開始的三元體資料推廣到家族資料,由於家族資料存在較多的染病個體,合理地利用家族資料檢定連鎖不平衡應該會得到更多的訊息,近年來的研究也多將資料結構推展擴大。目前最廣為應用的檢定統計量為TDT統計量,隨著TDT統計量衍生出釵h的統計量,其中包含PDT檢定統計,PDT統計量利用TDT統計量的想法,直接將統計模式應用於家族資料。本研究以家族資料檢定連鎖不平衡,試圖找出不同於TDT統計量的想法,並且將所提的統計量與已知的統計量互相比較,希望能得到檢定力較高的檢定統計量。
There are two types of data structures for linkage disequilibrium, family data and population data. Testing linkage disequilibrium using the family data should be more powerful than population data if the genetic markers and disease-susceptibility locus were linkage. And there are two types of the family data, triad families and pedigrees. Naturally, testing linkage in the pedigrees should be more powerful since there is at least one affected child and we can get more information from a pedigree. Based on the transmission disequilibrium test (TDT) many authors developed linkage testing in different data structures even to general pedigrees, one of these statistics is pedigree disequilibrium test (PDT). In this study we constructed two statistics which are more powerful and different from PDT statistic for testing linkage disequilibrium in pedigrees.
第一章 前言 1
第二章 文獻回顧
2.1 TDT檢定統計量 4
2.2 PDT檢定統計量 6
2.3 HHRR檢定統計量 7
第三章 研究方法
3.1 研究動機 9
3.2 三元體資料 9
3.3 家族資料 16
第四章 模擬
4.1 模擬步驟 19
4.2 三元體資料 21
4.3 家族資料 22
第五章 討論 24
圖 T1
附錄 I
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