臺灣博碩士論文加值系統

cDNA微陣列系統（cDNA microarray）之應用，在近年來越來越受到重視，也使得其發展漸近成熟，並能廣泛應用於各個領域，其對於基因表現的檢測更具有快速分析、準確率高以及可同時檢測大量基因之優點。
cDNA微陣列實驗中，會產生數量龐大的數據，要能有效的對基因表現數據進行分析與推論，統計方法的運用是重要的關鍵。實驗前，如何設計有效率的實驗程序，以減少實驗之變異，以及實驗結束後，如何分析大量的實驗數據，得到基因間之變化及相互關係，都是重要的統計議題。
本論文將著重於cDNA微陣列系統之實驗設計部分，探討在可用之晶片數給定下，如何安排實驗，比較許多有興趣之實驗種類，並且當實驗無法在同一時間內完成，必須分成不同批次，該如何來分批執行，且於每一批中安排哪些種類之樣本在晶片上做比較，使得這些樣本在各個基因之表現，能以最精確的方式被比較出來，此為本文之主要工作。
本文方法是將cDNA微陣列實驗之反應值，利用log ratio model建模與分析，推測該如何安排實驗，會使得此模型得到最精確之參數估計，也就是可較精確地得到各種類基因表現之比較。內容主要分成兩部份，第一部分為：在 D-optimality判別準則下，找到一個D-optimality之理論上界，這個上界可用來作為一個標準，判斷ㄧ實驗設計是否為最佳設計或與最佳設計相差多遠。第二部份為：根據此準則，利用電腦搜尋出在某些實驗條件下，有效之實驗設計。

目錄
第一章 緒論
1.1 前言………………………………………………………….. 1
1.2 統計於cDNA 微陣列實驗之應用……………………....... 1
1.3 文獻探討…………………………………………………….. 2
1.4 研究架構…………………………………………………….. 3
第二章 cDNA微陣列系統之實驗設計
2.1 cDNA微陣列實驗原理及流程……………………………… 4
2.2 研究問題之描述…………………………………………….. 6
2.3 模型之建立與假設………………………………………….. 7
第三章 Log Ratio Model 之最佳化設計
3.1 最佳化問題………………………………………………….. 11
3.2 最佳化問題之理論上界…………………………………….. 15
第四章 分批有效設計之建構
4.1 圖形表示法………………………………………………….. 20
4.2 評斷準則…………………………………………………….. 22
4.3 搜尋 S=V+2、S=2V ，b =2、3之有效設計
4.3.1 S=V+2 ， b=2、3之有效設計.........................23
4.3.2 S=2V，b =2、3之有效設計...........................25
4.4建構S=KV,b=K之有效設計..............................27
第五章 結論與後續研究 31
參考文獻 33
附錄一：搜尋S=V+2 、S=2V 分批之有效設計..............34
附錄二：搜尋S=KV分K 批之有效設計.....................37

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