臺灣博碩士論文加值系統

呼吸道症候群（Severe Acute Respiratory Syndrome）簡稱SARS，是在西元2003年由SARS冠狀病毒所引起的群體感染案例，死亡率高達一成。
確認作為抑制SARS冠狀病毒主要蛋白酶的核心結構後，本實驗室利用 Passerini reaction 作為中心反應，快速的合成此核心結構類似物，經過活性篩選後，發現化合物48的IC50 = 1.5 μΜ、化合物49的 IC50 = 0.1 μΜ、化合物50的IC50 = 10 μΜ都相當的好；雖然化合物並非本論文所預期有活性的化合物，但確信利用 Passerini reaction 作三元化反應可以有效率的得到大量分子庫，是此類抑制劑合成的一個不錯的選擇。

The Severe Acute Respiratory Syndrome is abbreviated as SARS, precededded in the colony caused of form virus by SARS and infected with the case in A.D. 2003, death rate is up to ten percent.
SARS-CoV Mpro has been shown to be essential for replication and is thus a target for drug discovery. In this thesis the Passerini reaction was used to synthesize the core structures of anti SARS-CoV Mpro inhibitors . After activity screening, the compounds 48、49 and 50 showed potent inhibitions against SARS-CoV Mpro with IC50 1.5 μΜ、0.1 μΜ and 10 μΜ, respectively. Although these compounds are not the inhibitors we expected，the approach by using Passerini reaction as key step is a good way to form tripeptide libraries.

目錄 I
圖表目錄 III
簡寫表 VI
中文摘要 VII
英文摘要 VIII
謝誌 Ⅸ
第一章 緒論 01
1-1 引言 01
1-2 SARS感染源 02
1-3 冠狀病毒的介紹 03
1-3-1 冠狀病毒的結構 04
1-3-2 SARS的檢測 06
1-3-3 各物種冠狀病毒基因組演化樹分析 07
1-3-4 冠狀病毒主要蛋白酶晶體分析 10
1-4 SARS的治療方法 15
1-4-1 抗病毒藥物 16
1-4-2 疫苗 17
1-4-3 近年來研究成果 18
1-4-4 SARS的生物週期 21
第二章 結果與討論 23
2-1-1 SARS冠狀病毒主要蛋白酶背景介紹 23
2-1-2 過渡態類似物的設計 25
2-1-3 SARS冠狀病毒主要蛋白酶的活性分析 28
2-1-4 SARS冠狀病毒主要蛋白酶抑制劑的設計與合成 31
2- 2-1 以Passerini反應為中心反應與多成份組合反應的介紹 36
2-2-2 利用Passerini反應合成α-羥基醯胺核心結構化合物 39
結論 47
第三章 實驗部份 48
3-1 一般實驗方法 48
3-2 實驗步驟及光譜資料 49
參考文獻 61
附錄 66

1.CDC. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and Coronavirus Testing---United States 2003, 297.
2.The Chinese SARS Molecular Epidemiology Consortium; Science 2004, 303, 1666.
3.WHO. Severe acute respiratory syndrome(SARS). Wkly Epidemiol Rec. 2003, 78, 217.
4.(a)Tsang, K. W.; Ho, P. L.; Ooi, G. C.; Yee, W. K.; Wang, T.; Chan-Yeung M.; Lam, W. K.; Seto, W. H.; Yam, L. Y.; Cheung, T. M.; Wong. P. C.; Lam, B.; Chan, J.; Yuen, K. Y.; Lai, K. N. N Engl J Med 2003; 348, 1977. (b)Lee, N.; Hui, D; Wu, A.; Chan, P.; Cameron P.; Joynt G. M.; Ahuja A.; Yung, M. Y.; Leung, C. B.; To, K. F.; Lui, S. F.; Szeto, C. C.; Chung, S.; Sung, J. J. Y. N Engl J Med 2003, 348, 1986.
5.Siddell, S. G. The Coronaviridae. In: H. Fraenkel-Conrat and R.R. Wagner, Editors The Viruses, Plenum Press, New York(1995).
6.Ksiazek, T. G.; Erdman, D.; Goldsmith, C. S.; Zaki, S. R.; Peret, T.; Emery, S.; Tong, S.; Urbani, C.; Comer, J. A.; Limv, W.; Rollin, P. E.; Dowell, S. F.; Ling, A. E.; Humphrey, C. D.; Shieh, W. J.; Guarner, J.; Paddock, C. D.; Rota, P.; Fields, B.; DeRisi, J.; Yang J. Y.; Cox, N.; Hughes, J. M.; LeDuc, J. W.; Bellini, W. J.; Anderson L. J. N. Engl. J. Med. 2003, 348, 1953.
7.Lai, M. C. Scientific American, Inc., New York. 2003, 16, 2
8.Stadle,Ｋ.;Masignani,Ｖ.;Eickmann,Ｍ.;Becke,Ｓ.;Abrignani,Ｓ.; Klenk,Ｈ.-Ｄ.;Rappuoli,R. Nature Microbiology 2003, 1, 209
9.Timani, K.; Ye, L.; Ye, L.; Zhu, Y.; Wu, Z.; Gong, Z. J. Clin. Virol. 2004, 309.
10.Rota, P. A.; Oberste, M. S.; Monroe, S. S.; Nix, W. A.; Campagnoli, R.; Icenogle, J. P.; Penaranda, S.; Bankamp, B.; Maher, K.; Chen, M.-H.; Tong, S.; Tamin, A.; Lowe, L.; Frace, M.; DeRisi, L. L.; Chen, Q.; Wang, D.; Erdman, D. D.; Peret, T. C. T.; Burns, C.; Ksiazek, T. G.; Rollin, P. E.; Sanchez, A.; Liffick, S.; Holloway, B.; Limor, J.; McCaustland, K.; Melissa O.-R.; Fouchier, R.; Gunther, S.; Osterhaus, A. D. M. E.; Drosten, C.; Pallansch, M. A.; Anderson, L. J.; Bellini, W. J. Science 2003, 300, 1394.
11.Marra, M. A.; Jones, S. J. M.; Astell, C. R.; Holt, R. A.; Angela, B. W.; Butterfield, Y. S. N.; Khattra, J.; Asano, J. K.; Barber, S. A.; Chan, S. Y.; Cloutier, A.; Coughlin, S. M.; Freeman, D.; Girn, N.; Griffith, O. L.; Leach, S. R.; Mayo, M.; McDonald, H.; Montgomery, S. B.; Pandoh, P. K.; Petrescu, A. S.; Robertson, A. G.; Schein, J. E.; Siddiqui, A.; Smailus, D. E.; Stott, J. M.; Yang, G. S.; Plummer, F.; Andonov, A.; Artsob, H.; Bastien, N.; Bernard, K.; Booth, T. F.; Bowness, D.; Czub, M.; Drebot, M.; Fernando, L.; Flick, R.; Garbutt, M.; Gray, M.; Grolla, A.; Jones, S.; Feldmann, H.; Meyers, A.; Kabani, A.; Li, Y.; Normand, S.; Stroher, U.; Tipples, G. A.; Tyler, S.; Vogrig, R.; Ward, D.; Watson, B.; Brunham, R. C.; Krajden, M.; Petric, M.; Skowronski, D. M.; Upton, C.; Roper, R. L. Science 2003, 300, 1399.
12.Bacha, U.; Barrila, J.; Velazquez-Campoy, A.; Leavitt, S. A.; Freire, E. Biochemistry 2004, 43, 4096.
13.(a)Matthews, D. A.; Smith, W. W.; Ferre, R. A.; Condon, B.; Budahazi, G.; Sisson, W.; Villafranca, J. E.; Janson, C. A.; McElroy, H. E.; Gribskov, C. L.; Worland, S. Cell, 1994, 77, 761.(b)Seipelt, J.; Guarne, A.; Bergmann, E.; James, M.; Sommergruber, W.; Fita, I.; Skern, T. Virus Res. 1999, 62, 159.
14.Peiris, J., Chu, C. M., Cheng, V. C. C., Chan, K. S., Hung, I. F. N., Poon, L. L. M., Law, K. I.,Tang, B. S. F., Hon, T. Y. W., Chan, C. S. Lancet 2003, 361, 1767.
15.Ksiazek, T. G.; Erdman, D.; Goldsmith, C. S.; Zaki, S. R.; Peret, T.; Emery, S.; Tong, S.; Urbani, C.; Comer, J. A.; Lim, W.; Rollin, P. E.; Dowell, S. F.; Ling, A.-E.; Humphrey, C. D.; Shieh,; W.-J.; Guarner, J.; Paddock, C. D.; Rota, P.; Fields, B.; DeRisi, J.; Yang, J.-Y.; Cox, N.; Hughes, J. M.; LeDuc, J. W.; Bellini, W. J.; Anderson, L. J. N. Engl. J. Med. 2003, 348, 1953.
16.Drosten, C.; Gunther, S.; Preiser, W.; van der Werf, S.; Brodt, H.-R.; Becker, S.; Rabenau, H.; Panning, M.; Kolesnikova, L.; Fouchier, R. A. M.; Berger, A.; Burguiere, A.-M.; Cinatl, J.; Eickmann, M.; Escriou, N.; Grywna, K.; Kramme, S.; Manuguerra, J.-C.; Muller, S.; Rickerts, V.; Sturmer, M.; Vieth, S.; Klenk, H.-D.; Osterhaus, A. D.M.E.; Schmitz, H.; Doerr, H. W. N. Engl. J. Med. 2003, 348, 1967.
17.Yang, H.; Yang, M.; Ding, Y.; Liu, Y.; Lou, Z.; Zhou, Z.; Sun, L.; Mo, L.;Ye, S.; Pang, H.; Gao, G. F.; Anand, K.; Bartlam, M.; Hilgenfeld, R.; Rao, Z. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 13190.
18.Anand, K.; Palm, G. J.; Mesters, J. R.; Siddell, S. G.; Ziebuhr, J.; Hilgenfeld, R. EMBO J. 2002, 21, 3213.
19.He, J.-F.; Peng, G.-W.; Min, J.; Yu, D.-W.; Liang, W.-J.; Zhang, S.-Y.; Xu, R.-H.; Virology group: Zheng, H.-Y.; Wu, X.-W.; Xu, J.; Wang, Z.-H.; Fang, L.; Zhang, X.; Li, H.; Yan, X.-G.; Lu, J.-H.; Hu, Z.-H.; Huang, J.-C.; Wan, Z.-Y.; Hou, J.-L.; Lin, J.-Y.; Molecular biology group: Song, H.-D.; Wang, S.-Y.; Zhou, X.-J.; Zhang, G.-W.; Gu, B.-W.; Zheng, H.-J.; Zhang, X.-L.; He, M.; Zheng, K.; Wang, B.-F.; Fu, G.; Wang, X.-N.; Chen, S.-J.; Chen, Z.; Data analysis group: Hao, P.; Tang, H.; Ren, S.-X.; Zhong, Y.; Guo, Z.-M.; Liu, Q.; Miao, Y.-G.; Kong, X.-Y.; He, W.-Z.; Li, Y.-X.; Wu, C.-I.; Zhao, G.-P.; Chinese University of Hong Kong group: Chiu, R. W. K.; Chim, S. S. C.; Tong, Y.-K.; Chan, P. K. S.; Tam, J. S.; Lo, Y. M. D. Science. 2004, 303, 1666.
20.Snijder, E. J.; Bredenbeek, P. J.; Dobbe, J. C.; Thiel, V.; Ziebuhr, J.; Poon, L. L. M.; Guan, Y.; Rozanov, M.; Spaan, W. J. M.; Gorbalenya, A. E. J. Mol, Biol. 2003, 331, 991.
21.Poutanen, S. M.; Low, D. E.; Henry, B., Finkelstein, S. N. Engl. J. Med. 2003, 348, 1995.
22.Avendano, M.;Derkach, P.; Swan, S.; CMAJ 2003, 168.
23.Cinatl, J.;Morgenstern, B.;Bauer, G.;Chandra, P.;Rabenau, H.;Doerr, H. W. Lancet 2003, 361, 2405.
24.Shie, J.J.; Fang, J. M.; Kuo, C. J.; Kuo, T. H.; Liang, P. H.; Huang, H. J.; Yang, W. B.; Lin, C. H.; Chen, J. L.; Wu, Y. T.; Wong, C. H. J. Med. Chem. 2005, 48, 4469.
25.Wu, C. Y.; King, K. Y.; Kuo, C. J.; Wu, Y. T.; Ho, M. Y.; Liao, C. L.; Fang, J. M.; Liang, P. H.; Wong, C. H Chem. Biol. 2003, 13, 261.
26.(a) Babine, R. E.; Bender, S. L. Chem. Rev. 1997, 97, 1359. (b) Ripka, A. S.; Rich, D. H. Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 441. (c) Craik, M. S.; Debouck, C.; McKerrow, J. H.; James, M. N. G.; Eds. ESCOM: Leiden, 1995; 2, 1. (d) Shaw, E. Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1990, 63, 271.
27.Huang, C.-K.; Wei, P.; Fan, K.; Liu, Y.; Lai, L. Biochemistry, 2004, 43, 4568-4574.
28.Nelson, D. L.;Cox, M. M. Lehninger Principles of Biochemistry 3rd Ed. WORTH.
29.Fersht, A. R.; Kirby A. J. Chem. Br. 1980, 16, 136.
30.Brik, A.; Wong, C.-H. Org. Biomol. Chem. 2003, 1, 5.
31.Kuo, C. J.; Chi, Y. H.; Hsu, J. T.-A.; Liang, P. H. Biochemical and Biophysical Research Communications 2004, 318, 862.
32.Wu, C.-Y.; Jan, J.-T.; Ma, S.-H.; Kuo, C.-J.; Juan, H.-F.; Cheng, Y.-S. E.; Hsu, H.-H.; Huang, H.-C.; Wu, D.; Brik, A.; Liang, F.-S.; Liu, R -S.; Fang, J.-M.; Chen, S.-T.; Liang, P.-H.; Wong, C.-H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 10012.
33.Anand, K.; Ziebuhr, J.; Wadhwani, P.; Mesters, J. R.; Hilgenfeld, R. Science 2003, 300, 1763.
34.Hegyi, A.; Ziebuhr, J. J. Gen. Virol. 2002, 83, 595.
35.Fan, K.; Wei, P.; Feng, Q.; Chen, S.; Huang, C.; Ma, L.; Lai, B.; Pei, J.; Liu, Y.; Chen, J.; Lai, L. J. Biol. Chem. 2004, 279 , 1637.
36.(a) Thiel, V.; Ivanov, K. A.; Putics, Á.; Hertzig, T.; Schelle, B.; Bayer, S.; Weißbrich, B.; Snijder, E. J.; Rabenau, H.; Doerr, H. W.; Gorbalenya, A. E.; Ziebuhr, J. J Gene Virol. 2003, 84, 2305. (b) Ziebuhr, J., Snijder, E. J. & Gorbalenya, A. E. J. Gen. Virol. 2000 ,81, 853.
37.Wallace, A. C.; Laskowski, R. A.; Thornton, J.M.; LIGPLOT: a program to generate schematic diagrams of protein-ligand interactions. Protein Engineering, 1995, 8, 127.
38.(a) Passerini, M. Gazz. Chim. Ital. 1921, 51, 126. (b) Passerini, M. Gazz. Chim. Ital. 1921, 51, 181. (c) Ugi, I.; Lohberger, S.; Karl, R. In Comprehensive Organic Synthesis; Trost, B. M., Fleming, I., Eds.; Pergamon: New York; 1991, 2, 1083.
39.Hellmann, G.; Opitz, H. -Aminoalkylierung, Verlag Chemine, Weinheim, 1961.
40.Name Reactions: A Collection of Detailed Reaction Mechanisms Li, J. J. Spinger-Verlag, Berlin Heidelberg, 2002, 269.
41.Dömling, A.; Ugi, I. Angew. Chem. Int. Ed. 2000, 39, 3168.
42.陳吉峰(民93)：SARS冠狀病毒蛋白酶抑制劑之開發與合成。國立台灣師範大學化學系碩士論文。