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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:蘇裔程
研究生(外文):Yi-Cheng Su
論文名稱:基因侵蝕之首次經歷時間分析
論文名稱(外文):First-passage time analysis on gene erosion
指導教授:潘瑋潘瑋引用關係
指導教授(外文):Wei Pan
學位類別:碩士
校院名稱:國立東華大學
系所名稱:應用物理研究所
學門:自然科學學門
學類:物理學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2006
畢業學年度:94
語文別:中文
論文頁數:66
相關次數:
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生物演化是一個相當複雜的現象。除了天擇以外,基因漂變也被認為是造成演化的重要因素之一。
在本論文中使用CA模型,在不考慮天擇也沒有發生突變的情況,初始條件為隨機的狀況下,討論子代和交配對象均不遠這兩種局部效應對演化造成何種影響,並討論基因漂變的可能過程。
研究中發現交配對象被侷限在個體附近會導致叢集現象的產生。在小族群下,族群大小與基因侵蝕所需代數成正比。由基因侵蝕所需代數的分佈的討論,我們將基因漂變的過程看成一個通過單邊界的首次通過時間問題,並針對裡面的參數加以討論。最後觀察叢集現象是否有可能使造成基因失衡。
Evolution of biology is a complex phenomenon and is always a hot research topic. Besides nature selection, genetic drift is considered to be an important factor in evolution.
With a simplified cellular automata model, we carry out our simulation for genetic drift. In the beginning of the simulation, two kinds of alleles distribute at random in space with equal probability. It is found that the generations of genetic erosion is proportion to the size of population.
We consider the process of genetic drift as a first passage time problem in which a continuous-time random walk approaches a boundary under a driving force. We can estimate the parameters in this problem.
Finally, we discuss the influence of clusters generated by limited gene dispersal on genetic drift.
第一章 序論 5
第二章 模型與方法 16
2.1 本論文使用的規則 16
2.2 叢集計算方法 19
2.3 無空間隔離之交配模型 20
2.4 基因侵蝕所需代數分佈 21
第三章 結果 24
3.1 亂數檢驗 25
3.2 基因空間中的叢集現象 26
3.3 平均基因侵蝕所需代數與族群大小 28
3.4 基因侵蝕所需代數分佈 31
3.5 ε與σ的估計 37
3.6 叢集現象討論 42
第四章 討論 44
第五章 結論 48
參考資料 49
附錄一 51
附錄二 57
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