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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:林昆億
研究生(外文):Kun-Yi Lin
論文名稱:親子三元體相關分析在逐次連鎖不平衡檢定方法與逐次概似函數方法之比較
論文名稱(外文):Comparison between Sequential TDT method and Sequential likelihood method in Association Studies using Case-parent triad families
指導教授:戴政戴政引用關係
學位類別:碩士
校院名稱:國立臺灣大學
系所名稱:流行病學研究所
學門:醫藥衛生學門
學類:公共衛生學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2007
畢業學年度:95
語文別:中文
論文頁數:70
中文關鍵詞:樣本數逐次機率比例檢定傳遞不平衡檢定統合參數概似函數
外文關鍵詞:sample sizesequential probability ratio testtransmission/disequilibrium testunified-parameter likelihood
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本研究使用父、母、染病孩子三元體的資料結構,分別利用統合參數概似函數及傳遞不平衡檢定,來進行連鎖分析。考慮在需要使用逐次過程的情況下,給定特定的疾病基因頻率在不同的遺傳模式下,根據本研究模擬分析顯示,使用結合統合參數概似函數和逐次機率比例檢定(SPRT)的統計量會比結合傳遞不平衡檢定(TDT)和逐次機率比例檢定的統計量到達判定界限所需的樣本數少。
In this paper, we use case-parent triad families as the data structure to demonstrate how to proceed sequential linkage analysis. We adopt two types of linkage methods, the unified-parameter likelihood method and the transmission/disequilibrium test (TDT) method, to implement this sequential test procedure. Under different genetic scenarios, our simulation studies show that the unified-parameter sequential likelihood method requires less sample sizes to reach the sequential decision boundary than the TDT sequential method.
第一章 緒論 1
第二章 文獻回顧 8
第一節 傳遞不平衡檢定(TDT) 8
第二節 統合參數概似函數分析方法 12
2.1 隱性模式 13
第三節 逐次過程 16
3.1 常見的逐次調整期中檢定的顯著水準模式例子 16
3.1.1 Pocock(1977)and O’Brien-Fleming(1979) 16
3.1.2 Slud and Wei(1982) 17
3.1.3 Lan and DeMets(1983) 18
3.2 逐次機率比例檢定(SPRT) 19
第三章 研究方法 22
第一節 統合參數概似函數方法顯性模式推導 23
第二節 統合參數概似函數分析方法和逐次機率比例檢定合併方法 26
第三節 傳遞不平衡檢定(TDT)和逐次機率比例檢定合併方法 28
第四章 模擬 31
第一節 模擬設定 31
第二節 模擬結果 34
第五章 討論 38
參考文獻 40
附錄 42
附錄一 Neyman-Pearson Lemma (Casella, 2002) 42
附錄二 SPRT臨界值(boundary)的推導 (Zakkula, 2004) 44
附錄三 傳遞不平衡檢定(TDT)的推導 (Bickel and Doksum,1997) 46
附錄四 隱性模式下,固定交配型之下,統合參數傳遞機率推導 49
附錄五 顯性模式下,固定交配型之下,統合參數傳遞機率推導 55
1.戴政(2002)遺傳流行病學—基因定位之遺傳設計與分析方法。臺北:藝軒圖書出版社。
2.陳光琦(2003)三元體家庭之一般化連鎖不平衡檢定分析。臺灣大學流行病學研究所博士論文。
3.王雅婷(2004)家族相關性研究之檢定力監測。臺灣大學流行病學研究所碩士論文。
4.王俊毅(2005)利用親本三元體家庭之概似函數建立數量性狀基因座定位之穩健相關檢定。臺灣大學流行病學研究所博士論文。
5.Bickel, Peter J. and Doksum, Kjell. (1997) Mathematical Statistic. Prentice Hall.
6.Bart Spiessens, Emmanuel Lesaffre, Geert Verbeke, KyungMann Kim, David L DeMets. (2000) An overview of group sequential methods in longitudinal clinical trials. Stat Methods Med Res 9: 497-515
7.Casella, George and Berger, R L. (2002) Statistical Inference. DUXBURY.
8.Kruglyak L. (1999) Prospects for whole-genomelinkage disequilibrium mapping of common disease genes. Nat Genet 22 (2): 139-144
9.Lan KKG, DeMets DL. (1983) Discrete sequential boundaries for clinical trials. Biometrika 70: 659-663

10.Lan KKG, Lanchin JM. (1990) Implementation of group sequential logrank tests in a maximum duration trial. Biometrics 46: 759-770.
11.Neyman, J. and Pearson, E. S. (1933) On the problem of the most efficient test of statistical hypotheses. Philos. Trans. Roy. Soc. Ser. A. 231 289-337.
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