依法律所設置之獨立機關於我國憲政運作上是新的嘗試，且與行政院間具有相對獨立性。考量目前行政、立法兩權在憲法結構上和政治上的僵局，及獨立機關本質上和行政一體、責任政治之衝突下，本文藉由觀察各國獨立機關起源及建置目的，確定我國獨立機關之獨立性具有堅強之憲法理由。
行政院於司法院大法官釋字第613號解釋發布後即修正「獨立機關與行政院關係運作說明」，認為獨立機關並無獨立為政策決定之職權，而僅為個案處理具獨立性，惟該號解釋表示獨立機關得排除行政監督，並未將獨立機關之決定區分為個案決定與通案政策決定。又行政院金融監督管理委員會組織法、國家通訊傳播委員會組織法及公平交易法皆賦予金管會、通傳會及公平會得為通案性政策決及法規擬訂之職權。故行政院顯然延伸該號解釋，並剝奪立法者賦予獨立機關政策決定之職權。
我國公平會依據公平交易法第25條規定，對於公平交易法之執行及政策之研擬，係基於實際執法經驗所研擬之競爭政策，當更具有解決問題、付諸實行的可能性。

An independent agency set up according to law is a brand new attempt in Taiwan’s constitutional framework. It is relatively independent from the Executive Yuan. Taking the current constitutional, political deadlock between executive and legislative powers and the innate incompatibility between independent agencies and politics of administrative unity and accountability into consideration, this thesis reviews the establishment of independent agencies in other countries and finds out some constitutional reasons in the independency of our independent agencies.
After Judicial Yuan Interpretation No. 613, Executive Yuan revised “The Relationship Statement between Independent Agencies and Executive Yuan”. E.Y. thought independent agencies have no power of decision-making independently and only deal with cases independently. But J.Y. Interpretation No. 613 thought independent agencies are relatively independent from the E.Y. and never thought the power of decision-making in independent agencies is divided into dealing with cases and making general policy. Moreover, “Organic Act Governing the Establishment of Financial Supervisory Commission, Executive Yuan”, “National Communications Commission Organization Act” and “Fair Trade Act”regulate that FSC, NCC and FTC have the power of making general policy or drawing up statutes. As a result, E.Y. wrongly explains J.Y. Interpretation No. 613 and takes off the power of making general policy in the independent agencies.
According to Article 25 of Fair Trade Act, FTC shall be in charge of the preparation and formulation of fair trade policy, laws and regulations. And FTC, which bases on its experiences of investigating and handling various activities impeding competition, could make effective and efficient competition policy.

第一章 緒論
第一節 問題意識
第二節 國內文獻回顧
第三節 研究範圍與研究方法
第二章 獨立機關制度之起源及建制之目的
第一節 美國—獨立機關起源處
第二節 日本
第三節 德國
第四節 法國
第五節 綜合分析
第三章 獨立機關設置之必要性
第一節 設置目的
第一項 政府部門之看法
第一款 釋字第 613 號解釋以前
第二款 釋字第 613 號解釋以後
第二項 學者之看法
第二節 賦予獨立機關「獨立性」
第一項 我國獨立機關建制之法源依據
第二項 獨立機關存在之必要性
第一款 獨立機關存在仍具合憲空間
第一目 釋字第 613 號解釋肯認獨立機關
第二目 立法者設置獨立機關係屬合憲
第二款 獨立機關與行政一體、責任政治原則之關係
第一目 釋字第 613 號解釋所謂之行政一體原則
第二目 行政院對所屬之獨立機關僅具間接監督權
第四章 獨立機關之職權應包括擬訂政策
第一節 實際案例：中油凍漲油價事件
第一項 事件背景
第二項 中油及台塑石化是否涉及違反公平交易法
第二節 釋字第 613 號解釋針對獨立機關之職權範圍
第一項 行政院不認為獨立機關有擬訂政策之職權
第二項 釋字第 613 號解釋僅表示獨立機關得排除行政監督
第三節 賦予獨立機關之獨立性應不分個案決定與通案決定
第四節 行政院無須為轄下之獨立機關之政策決定負政治責任
第一項 獨立機關之獨立性仍受監督
第二項 行政院不宜干涉獨立機關決定
第五節 政策決定範圍
第一項 我國公平會
第一款 立法背景
第二款 競爭政策
第一目 公平交易法第 1 條立法目的之規定
第二目 公平交易法第 46 條規定
第三款 實際情形
第一目 公平交易政策之擬訂事項（ policy making）
第二目 公平交易法規之擬訂事項（ rulemaking）
第二項 美國競爭法主管機關
第一款 美國 FTC 職掌項目包括競爭政策之研擬
第二款 美國 DOJ 反托拉斯署職掌項目亦包括競爭政策之研擬
第三項 日本競爭法主管機關
第一款 日本公平交易委員會職掌項目包括競爭政策之研擬
第二款 日本公平交易委員會之獨立性
第四項 小結
第五章 結論
第一節 獨立機關之職掌宜包括擬訂政策
第二節 中油凍漲油價問題
參考文獻
附錄 1：獨立機關的建制理念與原則
附錄 2：釋字第 613 號解釋
附錄 3：獨立機關與行政院關係運作說明

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