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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:張淑蘭
研究生(外文):Shu-Lan Chang
論文名稱:合成類法呢焦磷酸酯之螢光探針用以探討基質與十一異戊二烯焦磷酸酯合成酶之交互作用
論文名稱(外文):Synthesis of FPP Fluorescent Analogues to Probe the Interactions with Undecaprenyl Pyrophosphate Synthase
指導教授:陳昭岑
指導教授(外文):Chao-Tsen Chen
學位類別:碩士
校院名稱:國立臺灣大學
系所名稱:化學研究所
學門:自然科學學門
學類:化學學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2010
畢業學年度:98
語文別:中文
論文頁數:201
中文關鍵詞:類法呢焦磷酸螢光探針
外文關鍵詞:FPP fluorescent analogues
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十一異戊二烯焦磷酸合成酶 (Undecaprenyl Pyrophosphate Synthase, UPPs) 催化其天然受質法呢焦磷酸酯 (Farnesyl Pyrophosphate, FPP) 與八個異戊二烯焦磷酸酯 (Isopropyl Pyrophosphate, IPP) 進行縮合生成十一異戊二烯焦磷酸酯類似物 (Undecaprenyl Pyrophosphate, UPP),其在細菌細胞壁的合成中扮演將lipid II由細胞膜內翻轉至細胞膜外的角色。本論文設計四個FPP螢光類似物以追蹤細菌細胞壁的生合成。希望此四個FPP螢光類似物可以被UPPs辨識為天然受質並進行後續的鏈延長生合成反應,且能與已經修飾在UPPs底部的螢光團Alexa Fluoro 488 產生螢光共振能量轉移 (Fluorescence resonance energy transfer, FRET) 的現象,藉此來觀測鏈延長的過程。而另一目的則可以利用螢光性質來追蹤此生合成的產物最後座落的位置。
這四個FPP螢光探針分別為BD-GPP、DC-GPP、3HF-GPP以及GPP-3HF。其組成主要由螢光團連接香葉醇基焦磷酸酯 (geranyl pyrophosphate, GPP),如圖示。我們主要選擇三個放射峰在500 nm的螢光團。其中之一為boron-dipyrromethene (BODIPY),BODIPY 連接GPP的骨架結構與FPP相當類似,且此螢光團具有量子產率高以及光穩定性高的特性趨使我們利用此螢光團做為此系統的運用。而另一個螢光團為dicyanomethylenedihydrofuran (DCDHF),其具有分子結構極強的推拉偶極作用易於調控其螢光放射性質以及螢光團結構利於修飾小分子等特色。而第三個螢光團為3-hydroxyflavone (3-HF)。此螢光團在單一激發波長下可以有兩個不同波長的螢光放射峰,且此兩螢光放射峰的比例與環境極性密切相關,此性質也趨使我們將其運用在此系統。將此四個FPP螢光類似物測試其與UPPs的生物活性後卻發現皆無法進行鏈延長的反應。所以無法與已修飾於UPPs內部的Alexa Fluoro 488 產生FRET的現象,但此四個化合物可以當作UPPs良好的抑制劑。
Undecaprenyl pyrophosphate synthase (UPPs) catalyzes the reactions of eight isopentenyl pyrophosphate (IPP) with farnesyl pyrophosphate (FPP) to generate C55 undecaprenyl pyrophosphate (UPP), which is a carrier transporting lipid II across the membrane in the biosynthesis of bacteria cell wall. Four FPP fluorescent analogues are designed to aim for probing the biosynthetic pathway of bacterial cell wall. It is hoped that these FPP analgues can bind with UPPs as its natural substrate, and follow the original biosynthetic pathway. It is also hoped that these FPP analogues have fluorescence resonance energy transfer phenomena to Alexa Fluoro 488 that has been modified in the active site of UPPs when the chain elongation reaction occurs. In addition, we can apply the fluorescence property for probing the position of the biosynthetic product.
These FPP fluorescent analogues, denoted as BD-GPP、DC-GPP、3HF-GPP and GPP-3HF are composed of fluorophores and geranyl pyrophosphate (GPP) (see figure). Three fluorophores which emit at 500 nm are chosen. One of them is boron-dipyrromethene (BODIPY). The framework of BODIPY connected with geranyl pyrophosphate is similar to UPPs natural substrate, and its high quantun yield and photostability motivate us to apply it to our probe design. The second fluorophore is called dicyanomethylenedihydrofuran (DCDHF). The push-pull structural characteristics renders modification of its photophysical properties possible, and its amino group can be derived easily. The third fluorophore is 3-hydroxyflavone, which has dual emissions and the ratios of the two emissions depending on the polarity of microenvironment. This property that one fluorophore has dual emission stimulates us to apply this fluorophore to this system. After testing these four FPP analogues binding and biological properties activity with UPPs, we find these four FPP analogues can not proceed chain elongation reactions when bound in the active site of UPPs, but all of them can be reasonably good inhibitors.
目錄

目錄……………………………………………………………………………………I
圖目錄………………………………………………………………………………IV
表目錄………………………………………………………………………………X
化學符號縮寫………………………………………………………………………XI
中文摘要…………………………………………………………………………XII
英文摘要………………………………………………………………………XIV

第一章緒論……………………………………………………………………………1
1.1 前言……………………………………………………………………………1
1.1.1蛋白質異戊二烯轉移酶介紹………………………………………………2
1.1.2研究蛋白質異戊二烯轉移酶方法介紹………………………………………6
1.1.3 異戊二烯合成酶介紹……………………………………………………10
1.1.4 反式異戊二烯合成酶介紹…………………………………………………13
1.1.5順式異戊二烯合成酶介紹…………………………………………………15
1.1.6 細菌細胞壁生合成介紹……………………………………………………18
1.2 螢光探針介紹…………………………………………………………………21
1.2.1 螢光探針設計機制…………………………………………………………22
1.2.2 回顧本實驗室針對UPPs螢光探針設計介紹……………………………24
第二章 FPP螢光探針設計與合成…………………………………………………28
2.1研究動機…………………………………………………………………………28
2.2 螢光基團的特性、選擇及介紹…………………………………………………30
2.3 FPP螢光類似物合成介紹………………………………………………………39
2.3.1 BD-GPP 合成介紹…………………………………………………………39
2.3.2 DC-GPP合成介紹…………………………………………………………47
2.3.3 3HF-GPP合成介紹…………………………………………………………53
2.3.4 GPP-3HF合成介紹…………………………………………………………57
第三章 結果與討論…………………………………………………………………60
3.1 實驗說明…………………………………………………………………60
3.1.1 BD-GPP的光學性質………………………………………………………62
3.1.2 BD-GPP的螢光滴定實驗…………………………………………………64
3.1.3 BD-GPP的酵素動力學實驗………………………………………………68
3.1.4 BD-GPP與UPPs的模擬分析……………………………………………69
3.2 DC-GPP的光學性質…………………………………………………………70
3.2.1 DC-GPP的螢光滴定實驗………………………………………………72
3.2.2 DC-GPP的酵素動力學實驗………………………………………………74
3.2.3 DC-GPP與UPPs的模擬分析……………………………………………74
3.3 3HF-GPP的光學性質………………………………………………………75
3.3.1 3HF-GPP的螢光滴定實驗……………………………………………77
3.3.2 3HF-GPP的酵素動力學實驗……………………………………………79
3.3.3 3HF-GPP與UPPs的模擬分析……………………………………………79
3.4 GPP-3HF的光學性質………………………………………………………80
3.4.1 GPP-3HF的螢光滴定實驗……………………………………………82
3.4.2 GPP-3HF的酵素動力學實驗……………………………………………85
3.4.3 GPP-3HF的電腦模擬分析……………………………………………85
3.5 FPP 螢光探針物性與生物活性比較………………………………………91
3.6 等溫滴定微量熱法測試……………………………………………………93
3.7 GPP-3HF、3HF-GPP、BD-GPP、DC-GPP與Coumarin-FPP之比
較…………………………………………………………………………100
3.8 總結…………………………………………………………………………103
實驗部份……………………………………………………………………………104
一、一般敘述……………………………………………………………………104
二、合成步驟及光譜數據………………………………………………………106
三、螢光滴定實驗與Job plot測試方法………………………………………143
參考文獻……………………………………………………………………………145
附錄…………………………………………………………………………………151





















圖目錄

圖1-1 不同長度的異戊二烯結構及其最後反應產物……………………………1
圖 1-2 PFT催化Ras 蛋白進行異戊二烯修飾反應過程示意圖…………………3
圖 1-3 (A) PFT結構示意圖 (B) GGPT-II 結構示意圖…………………………3
圖 1-4 (A) PFT與鋅離子和產物結晶示意圖(B) 鋅離子催化cysteine中的硫攻擊
farnesyl pyrophosphate 反應示意圖……………………………………4
圖 1-5 (A) 基因剔除的GGPT-II結晶示意圖 (B) 基因剔除的GGPT-II與GGPP
共結晶示意圖…………………………………………………………………5
圖 1-6 GGPT-II催化修飾Rab蛋白反應過程示意圖………………………………6
圖 1-7 Gibbs教授及其研究團隊設計機制型探針結構示意圖…………………7
圖1-8 Poulter教授及其研究團隊設計機制型探針結構示意圖…………………7
圖 1-9 Gibbs教授及其研究團隊所設計抑制劑與PFT酵素反應示意圖………7
圖 1-10 DATFP 修飾於異戊二烯衍伸物結構示意圖……………………………8
圖 1-11 (A) Distefano教授及其研究團隊所發展光親核基團PFT受質類似物結
構圖 (B) Spielmann教授及其研究團隊所發展光親核基團PFT受質類
似物結構圖…………………………………………………………………9
圖 1-12 Gibbs 教授及其研究團隊設計引入同位素13C於FPP骨架結構示意圖…9
圖 1-13 (A) Waldmann教授及其研究團隊所發展之具螢光放射基團GGPT-II受質
類似物結構圖 (B) Waldmann教授及其研究團隊所發展之具螢光放射基團PFT、GGPT-I受質類似物結構圖………………………………………10
圖1-14 (A) 異戊二烯合成酶催化反應機制圖 (B) 生合成異戊二烯焦磷酸和二甲
基異丙基焦磷酸反應示意圖……………………………………………11
圖1-15 (A) 反式異戊二烯合成酶Heptaprenyl pyrophosphate synthase反應示意圖
(B) 順式異戊二烯合成酶Undecaprenyl pyrophosphate synthase反應示意
圖…………………………………………………………………………12
圖1-16 (A)異戊二烯合成酶分類示意圖(B)為異戊二烯合成酶合成碳數範圍…12
圖 1-17 法呢基焦磷酸酯合成酶反應機制示意圖……………………………13
圖 1-18 (A) 法呢基焦磷酸酯合成酶結構示意圖 (B) 法呢基焦磷酸酯合成酶
帶有DDXXD序列部分結構放大圖……………………………………14
圖 1-19 (A) 硫化二甲基異丙基焦磷酸與法呢基焦磷酸酯與鎂離子共結晶圖
(B) 硫化二甲基異丙基焦磷酸與異戊二烯焦磷酸於法呢基焦磷酸酯合
成酶中的相對位置圖……………………………………………………14
圖 1-20 十一異戊二烯焦磷酸合成酶結晶示意圖……………………………15
圖 1-21 (A) UPPs成活性狀態結構圖 (B) UPPs非活性狀態結構圖………16
圖 1-22 (A) 鎂離子與Farnesyl thiopyrophosphate (FsPP) 與UPPs的共結晶圖
(B) 鎂離子與isoprenyl pyrophosphate (IPP) 與UPPs的共結晶圖……16
圖 1-23 Farnesyl thiopyrophosphate (FsPP) 於UPPs的活性位置模擬圖……17
圖 1-24 順式異戊二烯焦磷酸合成酶催化鏈延長反應的反應機制圖…………18
圖 1-25 細菌細胞壁生合成於細胞質部分生合成示意圖………………………19
圖 1-26 MraY催化生成lipide I反應機制示意圖 (A) 兩步驟催化反應機制
(B)一步反應機制…………………………………………………………20
圖 1-27 Mra G催化lipid I生成lipid II反應機制示意圖……………………21
圖 1-28 細菌細胞壁生合成於細胞質內翻轉至細胞膜外部分生合成示意圖…21
圖 1-29 螢光探針偵測特定受質示意圖…………………………………………22
圖 1-30 Jablonski diagram………………………………………………………22
圖 1-31 FRET機制中光子給予者 (Donor) 螢光放射光譜與光子接受者
(Acceptor) 紫外光/可見光吸收光譜重疊示意圖……………………24
圖 1-32 FRET發生機制示意圖………………………………………………… 24
圖 1-33 本實驗室所合成完成的FPP類似物螢光探針…………………………25
圖1-34 fluorescein 內酯與開環結構互換示意圖………………………………25
圖 2-1 FPP螢光類似物進行鏈延長反應與Alexa fluoro 488產生FRET現象
示意圖……………………………………………………………………28
圖 2-2 本論文目標合成分子結構圖…………………………………………30
圖 2-3 BODIPY中心結構……………………………………………………31
圖 2-4水溶性BODIPY結構示意圖…………………………………………32
圖 2-5 Burgess教授在BODIPY6號位置引入水溶性高之取代基的合成機
制………………………………………………………………………33
圖 2-6 2-Dicyanomethylene-3-cyano-2,5-dihydrofuran (DCDHF) 主體結構…34
圖 2-7 DCDHF螢光團在溶液狀態和結冰狀態的螢光增強圖………………34
圖 2-8 DCDHF螢光團在輻射以及非輻射能量示意圖………………………35
圖 2-9 Hilderbrand教授設計探測硫醇官能基探針示意圖…………………36
圖 2-10 3-羥基黃酮結構圖……………………………………………………36
圖 2-11 (A) ESICT和ESIPT螢光放射光譜圖 (B) ESICT和ESIPT發生結構示意
圖………………………………………………………………………37
圖 2-12 不同推拉電子基效應、溶劑對ESICP/ESIPT平衡的影響……………38
圖 2-13 設計偵測膜偶極差的三羥基黃酮分子結構圖………………………39
圖 2-14 BD-GPP第一次逆合成分析…………………………………………40
圖 2-15 BD-GPP第二次逆合成分析…………………………………………41
圖 2-16 2,4-dimethyl進行 pyrroleVilsmeier-Haack反應機制示意圖…………43
圖 2-17 (A) 與tris (tetra-n-butylammonium) diphosphate攪拌前19F NMR光譜圖
(B) 與tris (tetra-n-butylammonium) diphosphate攪拌後19F NMR光譜
圖………………………………………………………………………45
圖 2-18將guanosine triphosphate 修飾於BODIPY骨架結構示意圖………46
圖 2-19 DC-GPP逆合成分析…………………………………………………48
圖 2-20 除去sulfonamide 保護的反應機制示意圖……………………………51
圖 2-21 Meta-Geranyl-OH合成流程圖…………………………………………52
圖 2-22 3HF-GPP徐佳玟學姐的逆合成分析……………………………………53
圖 2-23 改進後的3HF-GPP逆合成分析………………………………………54
圖 2-24 GPP-3HF逆合成分析…………………………………………………57
圖 3-1 BD-GPP在水中標準化的吸收和放射光譜……………………………62
圖 3-2螢光量子產率測式示意圖……………………………………………63
圖 3-3 BD-GPP於水中、乙醇、二甲碸的紫外光/可見光吸收光譜…………63圖 3-4 BD-GPP於水中、乙醇、二甲碸的螢光放射光譜……………………64
圖 3-5 (A) BD-GPP與UPPs螢光滴定光譜圖(B) BD-GPP於UPPs中與FPP的反螢光滴定光譜圖……………………………………………………………65
圖 3-6 BD-GPP溶於D2O中,隨著時間偵測19F訊號…………………………66
圖3-7 BD-GPP 與O-MANT的混合螢光光譜圖……………………………67
圖 3-8 BD-GPP與O-MANT的與UPPs的螢光滴定光譜圖………………67
圖 3-9 BD-GPP濃度與UPPs的相對活性圖…………………………………69
圖 3-10 (A) BD-GPP與FPP的結構疊合圖 (B) BD-GPP與FPP在UPPs內部
模擬圖……………………………………………………………………70
圖 3-11 DC-GPP在水中標準化的吸收和放射光譜…………………………70
圖 3-12 DC-GPP於水中、乙醇、二甲碸的紫外光/可見光吸收光譜…………71
圖 3-13 DC-GPP於水中、乙醇、二甲碸的螢光放射光譜……………………72
圖 3-14 (A) DC-GPP與UPPs螢光滴定光譜圖(B) DC-GPP和UPPs與FPP的反
螢光滴定的重疊螢光光譜圖………………………………………………73
圖 3-15 DC-GPP濃度與UPPs的相對活性圖…………………………………74
圖 3-16 (A) DC-GPP與FPP的結構疊合圖 (B) DC-GPP與FPP在UPPs內部模
擬圖…………………………………………………………………………75
圖 3-17 3HF-GPP於水中標準化的吸收和放射光譜…………………………76
圖 3-18 3HF-GPP於水、乙醇、二甲亞碸的紫外光/可見光吸收光譜…………76
圖 3-19 3HF-GPP於水、乙醇、二甲亞碸的螢光放射光譜………………………77
圖 3-20 (A) 3HF-GPP與UPPs的螢光滴定光譜圖(B) 3HF-GPP和UPPs與FPP的反螢光滴定光譜圖………………………………………………………78
圖 3-21 3HF-GPP濃度與UPPs的相對活性圖…………………………………79
圖 3-22 (A) 3HF-GPP與FPP的結構疊合圖 (B) 3HF-GPP與FPP在UPPs內部
模擬圖……………………………………………………………………80
圖 3-23 GPP-3HF在水中的吸收和放射光譜…………………………………81
圖 3-24 GPP-3HF於水中、乙醇、二甲碸的紫外光/可見光吸收光譜…………81
圖 3-25 GPP-3HF於水中、乙醇、二甲碸的螢光放射光譜……………………82
圖 3-26 (A) GPP-3HF與UPPs的螢光滴定光譜圖 (B) GPP-3HF和UPPs與FPP
的反螢光滴定光譜圖………………………………………………………83
圖 3-27 3HF-GPP與GPP-3HF骨架結構示意圖……………………………84
圖 3-28 GPP-3HF濃度與UPPs的相對活性圖……………………………………85
圖 3-29 (A) GPP-3HF與FPP的結構疊合圖 (B) GPP-3HF 與FPP在UPPs內部
模擬圖………………………………………………………………………86
圖 3-30 (A) 3HF-GPP與UPPs Job plot圖 (B) 3HF-GPP與UPPs Job plot螢光光譜圖…………………………………………………………………………87
圖3-31 FPP螢光探針與UPPs螢光滴定平衡圖: (A) BD-GPP (B) DC-GPP (C) 3HF-GPP (D) GPP-3HF…………………………………………………91
圖3-32 (A) DC-GPP與BD-GPP之螢光isotherm疊圖 (B) 3HF-GPP與GPP-3HF
之螢光isotherm疊圖………………………………………………………92
圖3-33 (A) ITC儀器原理示意圖 (B) B1 : ITC測試訊號示意圖 B2 : ITC測試後訊
號整理示意圖…………………………………………………………94
圖3-34 Thermovac儀器示意圖…………………………………………………95
圖3-35 C值差異與訊號強度示意圖………………………………………………96
圖 3-36 (A) 3HF-GPP 滴加入25 mM Tris,150 mM NaCl 緩衝液ITC圖譜 (B)
3HF-GPP滴加入含有UPPs的緩衝溶液中………………………………97
圖3-37 (A) 3HF-GPP滴加入UPPs螢光示意圖(B) 3HF-GPP滴加入UPPs至2當
量IPT強度變化示意圖…………………………………………………98
圖3-38 (A) GPP-3HF滴加入UPPs螢光示意圖(B) GPP-3HF滴加入UPPs至1.8
當量IPT強度變化示意圖……………………………………………99
圖3-39本論文所設計四個FPP螢光探針與Cormarin-FPP結構電腦模擬疊合
圖…………………………………………………………………………101
圖3-40 (A) BD-GPP與Cormarin-FPP於UPPs中的結構疊合圖 (B)
DC-GPP與Cormarin-FPP於UPPs中的結構疊合圖 (C) 3HF-GPP
與Cormarin-FPP於UPPs中的結構疊合圖 (D) GPP-3HF與
Cormarin-FPP於UPPs中的結構疊圖………………………………102
流程圖3-1 實驗流程………………………………………………………………61














表目錄
表1-1 FPP螢光類似物性質整理……………………………………………………27
表3-1本論文之四個FPP螢光類似物性質…………………………………………93
1.Wang, K. C.; Ohnuma, S.-I. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1529, 33-48.
2.Windsor, W. T.; Syto, R.; Wang, L.; Bond, R.; Wu, Z.; Schwartz, J.; Le, H. V.; Beese, L. S.; Weber, P. C. Biochemistry 1998, 37, 16601-16611.
3.Sen, S. E.; Ewing, G. J. J. Org. Chem. 1997, 62, 3529-3536.
4.Zhang H. Protein prenyltransferases; John Wiley & Sons Publishers, 2004;
p 37-48
5.Farnsworth, C. C.; Seabra, M. C.; Ericsson, L. H.; Gelb, M. H.; Glomset, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 11963-11967.
6.Zahn, T. J.; Haworth, K. B.; Hicks, K. A.; Fierke, C. A.; Gibbs, R. A. Biochemistry 2005, 44, 11214-11223.
7.Park, H. W.; Boduluri, S. R.; Moomaw, J. F.; Casey, P. J.; Beese, L. S. Science 1997, 275, 1800-1805.
8.Zhang, H.; Seabra M.C.; Deisenhofer J. Struct. Fold. Des. 2000, 8, 241-51.
9.Guo, Z.; Wu Y.-W.; Das, D.; Delon, C.; Cramer, J.; Yu, S.; Thuns, S.; Lupilova, N.; Waldmann, H.; Brunsveld, L.; Goody, R. S.; Alexandrov, K.; Blankenfeldt, W. EMBO J. 2008, 27, 2444-2456.
10. Kale, T. A.; Hsieh S.A.; Rose, M.W.; Distefano, M.D. Curr. Top. Med. Chem. 2003, 3, 1043-1074
11. Mu, Y.; Omer, C. A.; Gibbs, R. A. J. Am.Chem. Soc. 1996, 118, 1817-1823.
12. Dolence, J. M.; Poulter, C. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.1995, 92, 5008-5011.
13. Gibbs, R. A.; Krishnan, U.; Dolence, J. M.; Poulter, C. D. J. Org. Chem. 1995, 60, 7821-7829.
14.Gibbs, R. A.; Krishnan, U.; Dolence, J. M.; Poulter, C. D. J. Org. Chem. 2002, 60, 7821-7829.
15. Baba, T.; Allen, C. M. Biochemistry 1984, 23, 1312-1322.
16.Kale, T. A.; Raab, C.; Yu, N.; Dean, D. C.; Distefano, M. D. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4373-4381.
17.Chehade, A. H.; Kiegiel, K.; Isaacs, R. J.; Pickett, J. S.; Bowers, K. E.; Fierke, C. A.; Andres, D. A.; Spielmann, H. P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 8206-8219.
18. Zahn, T. J.; Eilers, M.; Guo, Z.; Ksebati, M. B.; Simon, M.; Scholten, J. D.; Smith, S. O.; Gibbs, R. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7153-7164.
19.Owen, D. J.; Alexandrov, K.; Rostkova, E.; Scheidig, A. J.; Goody, R. S.; Waldmann, H. Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 509-512.
20.Dursina, B.; Reents, R.; Delon, C.; Wu, Y.; Kulharia, M.; Thutewohl, M.; Veligodsky, A.; Kalinin, A.; Evstifeev, V.; Ciobanu, D.; Szedlacsek, S. E.; Waldmann, H.; Goody, R. S.; Alexandrov, K. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2822-2835.
21. Liang, P.-H. Biochemistry 2009, 48, 6562-6570.
22. Ogura, K.; Koyama, T. Chem. Rev. 1998, 98, 1263-1276.
23. Brown, E. D.; Wright, G. D. Chem. Rev. 2005, 105, 759-774.
24. Kharel, Y.; Koyama, T. Nat. Prod. Rep. 2003, 20, 111-118.
25. Poulter, C. D. Phytochem. Rev. 2006, 5, 17-26.
26. Song, L.; Poulter, C. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 3044-3048.
27. Kellogg, B. A.; Poulter, C. D. Biochemistry 2000, 39, 15316-15321.
28.Hosfield, D. J.; Zhang, Y.; Dougan, D. R.; Broun, A.; Tari, L. W.;
Swanson, R.V.; Finn, J. J. Biol. Chem. 2004, 279, 8526-8529.
29.Ko, T.- P.; Chen, Y.K.; Robinson, H.; Tsai, P. C.; Gao, Y.-G.; Chen, A. P.-C.; Wang, A. H.-J.; Liang, P.-H. J. Biol. Chem. 2001, 276, 47474-47482.
30. Chang S.-Y.; Ko T.-P.; Chen P.-C.; Wang H.-J.; Liang, P.-H. Protein Sci. 2004, 13, 971-978.
31.Guo, R.-T.; Ko, T.-P.; Chen, A. P.-C.; Kuo, C.-J.; Wang, A. H.-J.; Liang, P.-H. J. Biol. Chem. 2005, 280, 20762-20774.
32.Que, E. L.; Domaille, D. W.; Chang, C. J. Chem. Rev. 2008, 108, 4328-4328.
33. Guo, X.; Qian, X.; Jia, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2272-2273.
34. Chen, C.-T.; Huang, W.-P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6246-6247.
35. Yogo, T.; Urano, Y.; Mizushima, A.; Sunahara, H.; Inoue, T.; Hirose, K.; Iino,
M.; Kikuchi, K.; Nagano, T. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 28-32.
36. Lakowicz, J. R., Ed. Principles of Fluorescence Spectroscopy; Plenum
Publishers Corp.: New York, 1999.
37. Stryer, L.; Haugland, R. P. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1967, 58, 719-726.
38.Chen, P. C.; Chen, Y.-H.; Liu, H.-P.; Li, Y.-C.; Chen, C.-T.; Liang, P.-H. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 15217-15224.
39.李育瑾. 國立台灣大學化學所碩士論文,以法呢焦磷酸酯螢光類似物探測十一異戊二烯焦磷酸合成酶的活性中心和反應構形變化, 2004. 7月
40.Schmitt, A.; Hinkeldey, B.; Wild, M.; Jung, G. J. Fluoresc. 2009, 19, 755-758.
41.Loudet, A.; Burgess, K. Chem. Rev. 2007, 107, 4891-4932.
42.Ulrich, G.; Ziessel, R.; Harriman, A. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 1184-1201.
43.Shah, M.; Thangaraj, K.; Soong, M.-L.; Wolford, L. T.; Boyer, J.H.; Politzer, I. R.; Pavlopoulos, T. G. Heteroat. Chem. 1990, 1, 389-399.
44.Boyer, J.H.; Haag, A. M.; Sathyamoorthi, G.; Soong M. L.; Thangaraj K.; Pavlopoulos T. G. Heteroat. Chem. 1993, 4, 39-49.
45.Wagner, R. W.; Lindsey, J. S. Pure Appl. Chem. 1996, 68, 1373-1380.
46.Nicolaou, K. C.; Claremon, D. A.; Papahatjis, D. P. Tetrahedron Lett. 1981, 22, 4647-4650.
47.Tahtaoui, C.; Thomas, C.; Rohmer, F.; Klotz, P.; Duportail, G.; Mely, Y.; Bonnet, D.; Hibert, M. J. Org. Chem. 2007, 72, 269-272.
48.Rohand, T.; Baruah, M.; Qin, W.; Boens N.; Dehaen, W. Chem. Commun. 2006, 266-268.
49.Baruah, M.; Qin, W.; Vallee, R. A. L.; Beljonne, D.; Rohand, T.; Dehaen, W.; Boens, N. Org. Lett. 2005, 7, 4377-4380.
50.Yogo, T.; Urano, Y.; Ishitsuka, Y.; Maniwa, F.; Nagano, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12162-12163.
51.Mikhalyov, I.; Gretskaya, N.; Johansson, L. B. Chem. Phys. Lipids 2009, 159, 38-44.
52.Carlsen, C. U.; Kurtmann, L.; Bruggemann, D. A.; Hoff, S.; Risbo, J.; Skibsted, L. H. Cryobiology 2009, 58, 262-267.
53.Niu, S. L.; Ulrich, G.; Ziessel, R.; Kiss, A.; Renard, P.-Y.; Romieu, A. Org. Lett. 2009, 11, 2049-2052.
54.Thivierge, C.; Bandichhor, R.; Burgess, K. Org. Lett. 2007, 9, 2135-2138.
55. Lu, H.; Xiong, L.; Liu, H.; Yu, M.; Shen, Z.; Li, F.; You, X. Org. Bio. Chem. 2009, 7, 2554-2558.
56.Du, J.; Fan, J.; Peng, X.; Li, H.; Wang, J.; Sun, S. J. Fluoresc. 2008, 18, 919-924.
57.Inoue, N.; Suzuki, Y.; Yokoyama, K.; Karube, I. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2009, 73, 1215-1217.
58. Lee, J.-S.; Kang, N.; Kim, Y. K.; Samanta, A.; Feng, S.; Kim, H. K.; Vendrell, M.; Park, J. H.; Chang, Y.-T. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 10077-10082.
59.Willets, K. A.; Nishimura, S. Y.; Schuck, P. J.; Twieg, R. J.; Moerner, W. E. Acc. Chem. Res. 2005, 38, 549-556.
60. Lord, S. J.; Conley, N. R.; Lee, H.D.; Nishimura, S. Y.; Andrea K. P.; Willets, K. A.; Liu, R.; Samuel, R.; Weber, R.; Twieg, R. J.; Moerner, W. E. Chem. Phys. Chem. 2009, 10 , 55-65.
61.Lord, S. J.; Lu, Z.; Wang, H.; Willets, K. A.; Schuck, P. J.; Lee, H. D.; Nishimura, S. Y.; Twieg, R. J.; Moerner, W. E. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8934-8941.
62.Callis, P. R.; Moerner, W. E. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10465-10473.
63.Nishimura, S. Y.; Lord, S. J.; Klein, L. O.; Willets, K. A.; He, M.; Lu, Z.; Twieg, R. J.; Moerner, W. E. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 8151-8157.
64.Bouffard, J.; Kim, Y.; Swager, T. M.; Weissleder, R.; Hilderbrand, S. A. Org. Lett. 2008, 10, 37-40.
65.Celej, M. S.; Caarls, W.; Demchenko, A. P.; Jovin, T. M. Biochemistry 2009, 48, 7465-7472
66.徐佳玟 本實驗室未發表研究結果2007.
67. Chou, P.-T.; Huang, C.-H.; Pu, S.-C.; Cheng, Y.-M.; Liu, Y.-H.; Wang, Y.; Chen, C.-T. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6452-6454.
68.Sathish, S.; Narayan, G.; Rao, N.; Janardhana, C. J. Fluoresc. 2007, 17, 1-5.
69.M`Baye, G.; Shynkar, V.; Klymchenko, A.; Mély, Y.; Duportail, G. J. Fluoresc. 2006, 16, 35-42.
70.Meng, Q.; Kim, D. H.; Bai, X.; Bi, L.; Turro, N. J.; Ju, J. J. Org. Chem. 2006, 71 , 3248-3252.
71.Andrew B.; Woodside, Z. H.; Poulter, C.D. Org. synth. 1993, 8, 616-620.
72.Ruparel, H.; Bi, L.; Li, Z.; Bai, X.; Kim, D. H.; Turro, N. J.; Ju, J. Proc. Nat.l Acad. Sci. USA 2005, 102, 5932-5937.
73.Li, Z.; Bai, X.; Ruparel, H.; Kim, S.; Turro, N. J.; Ju, J. Proc. Nat.l Acad. Sci. USA 2003, 100, 414-419.
74.Walton, R.; Lahti, P. M. Syn. Comm. 1998, 28, 1087-1092.
75.Fukuyama, T.; Jow, C.-K.; Cheung, M. Tetrahedron Lett. 1995, 36, 6373-6374.
76.Arbeloa, F. L.; Arbeloa, T. L.; Arbeloa, I. L.; Moreno, I. G.; Costela, A.; Sastre, R.; Guerri, F. A. Chem. Phys. 1998, 236, 331-341.
77. Miki, K.; Koyama, T.; Li, X. Y; Hihuchi, Y.; Zhang, Y. W.; Fujihashi, M. Proc. Nat.l Acad. Sci. USA 2001, 98, 4337-4342.
78. Babetta, L. M.; James, H. J.; Thomas, M. Y.; John, P. N.; Julia, M. C.; Robert,
C. H.; Xiaomei Y. Anal. Biochem. 2000, 286, 138-148
79. Frommer, W. B.; Jakobsen, I.; Kossmann, J.; Grossman, A.R.; Scharff-Poulsen,
A. M.; Looger, L. L.; Okumoto, S.; Lalonde, S.; Hong G. FEBS Lett, 2006, 580, 5885-5893.
80. Lalonde, S.; Frommer, W. B.; Fehr, M. Proc. Nat.l Acad. Sci. USA 2002, 99, 9846-9851.
81. Robert, A. H.; Dennis, M. H.; David, R.; Katherine, T. P.; Sivan, V. M.
Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2004, 286, 302-316.
82. Bourson, J.; Pouget, J.; Valeur, B.; Ingham, K.C. J. Phy. Chem. 1993, 97,
4552-4557.
83. Dursina, B.; Reents, R.; Delon, C.; Yaowen, W. ; Kulharia, M.; Thutewohl, M.; Veligosky, A.; Kalinin, A.; Evstifeev, V.; Ciobanu, D.; Szediacsek, S. E.; Waldmann, H. Goody, R.S., Alexandrov, K. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 2822-2835.
84. Wiseman, T.; Williston, S.; Brandts, J. F.; Lin, L. N. Anal. Biochem, 1989, 179, 131-137.
85.Alexandrova, L. A.; Jasko, M. V.; Belobritskaya, E. E.; Chudinov, A. V.; Mityaeva, O. N.; Nasedkina, T. V.; Zasedatelev, A. S.; Kukhanova, M. K. Bioconjugate Chem. 2007, 18, 886-893.
86.Wu, L.; Burgess, K. Chem. Commun. 2008, 40, 4933-4935.
87.Briggs, J. R.; Klosin, J.; Whiteker, G. T. Org. Lett. 2005, 7, 4795-4798.
88.Tao, Z.; Peng, G.; Ling, Q.; Yuquan, S. Synth. Commun. 2006, 36, 1367-1372.
89.Vazquez, M. E.; Blanco, J. B. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1300-1306.
QRCODE
 
 
 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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