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研究生:曾琳文
研究生(外文):Lin-Wen Tseng
論文名稱:具多元家庭結構的家族資料之加權合併相關分析
論文名稱(外文):Weighted Combination Association Analysis of Pedigree Data with Different Families Structures
指導教授:戴 政侯家鼎侯家鼎引用關係
指導教授(外文):John Jen TaiChia-Ding Hou
口試委員:邵曰仁蔡典龍李昭憲
口試日期:100/6/23
學位類別:碩士
校院名稱:輔仁大學
系所名稱:應用統計學研究所
學門:數學及統計學門
學類:統計學類
論文種類:學術論文
論文出版年:2011
畢業學年度:99
語文別:中文
論文頁數:73
中文關鍵詞:家族資料相關分析親子四元體加權合併
外文關鍵詞:pedigree dataassociation analysistetrad familiesweighted combination
相關次數:
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透過遺傳分析可以了解基因變異對於人類染病的影響,而基因定位中的相關分析,主要是檢定標識基因和疾病基因兩者的關係程度。因為家族資料比家庭資料隱含了更大量的遺傳資訊,近代有越來越多篇的研究都利用家族資料作為分析對象。在過去的研究文獻中,以家族資料為基礎架構的相關分析,多是萃取家族中的不一致二元體同胞對、親子三元體與相似度分數等遺傳訊息,但是親子四元體的訊息卻從未被考量,於是本研究將討論親子四元體在家族資料下對於相關檢定的貢獻能力。此外,本研究嘗試將舊有的相關檢定統計量進行改造與創新,並把加權想法引入家族遺傳訊息量,此通式乃包含了親子三元體、二元體同胞對、親子四元體以及相似度分數,為較具一般化性質的通式。模擬的研究結果指出,把親子四元體的訊息納入統計量可以使相關分析的檢定力更佳。
The aim of genetic association analysis is to identify the extent of association between a genetic marker and a disease. Because pedigree data contain more association information than familial data, use of pedigree data to develop association tests has received attention in this area. The previously developed pedigree association methods had used information of familial data structures of case-control groups, concordant-discordant sib-pairs and case-parent triads generated from pedigrees. However, tetrad families have not been considered. In this thesis, pedigree association tests developed by incorporating case-parent tetrad families are proposed. Several weighted combined test statistics, which combine information of case-control groups, concordant-discordant sib-pairs, triad families and tetrad families, are investigated. Simulation studies indicate that incorporation of tetrad families does enhance the testing power in genetic association analysis.
目  錄
第壹章 緒論 1
第一節 研究背景與動機 1
第二節 研究問題與目的 3
第三節 研究架構 4
第貳章 文獻探討 5
第一節 親子三元體的相關檢定 6
第二節 親子四元體的相關檢定 8
第三節 家族資料的相關檢定 10
第四節 相似度訊息分數 14
第參章 研究方法 19
第一節 親子四元體遺傳訊息 20
第二節 加權的家族遺傳訊息 23
第肆章 模擬分析 27
第一節 家族資料的模擬 29
第二節 四元體與訊息度的表現與篩選 33
第三節 統計量結構的改良 39
第四節 各遺傳參數對檢定力之影響 48
第伍章 結論與建議 54
第一節 研究結論 54
第二節 研究限制與建議 55
參考文獻 57
附錄 各統計量之型一誤差 61

參考文獻
何世屏 (2009)。遺傳學:分子探索。臺中市:五南圖書出版股份有限公司。
吳性慧 (2006)。利用親子二元體資料建立尋找疾病基因的相關分析。國立台灣大學流行病學研究所碩士論文,臺北市。
邱文雍 (2008)。合併親子三元體資料標識基因下傳/不下傳訊息與相似度訊息之相關分析方法。國立台灣大學流行病學研究所碩士論文,臺北市。
武光東、劉權章 (1998)。遺傳諮詢。臺北市:合記圖書出版社。
范文穎 (2008)。利用家族資料不同型式相關訊息建立家族相關檢定方法。天主教輔仁大學應用統計研究所碩士論文,新北市。
鄭又綸 (2009)。家族資料相關檢定之遺傳訊息萃取與合併方法探討。天主教輔仁大學應用統計研究所碩士論文,新北市。
戴政 (2002)。遺傳流行病學:基因定位之遺傳設計與分析方法。新北市:藝軒圖書文具有限公司。

Abel, L., Alcais, A., & Mallet, A. (1998). Comparison of four sib-pair linkage methods for analyzing sibships with more than two affecteds: interest of the binomial maximum likelihood approach. Genetic Epidemiology, 15(4), 371-390.
Bhattacharya, N. (1961). Sapling experiments on the combination of independent -tests. Sankhya Ser. A, 23(2), 191-196.

Blackwelder, W. C., & Elston, R. C. (1985). Acomparison of sib-pair linkage tests for disease susceptibility loci. Genetic Epidemiology, 2(1), 85-97.
Bourgain, C., Genin, E., Quesneville, H., & Clerget-Darpoux, F. (2000). Search for multifactorial disease susceptibility genes in founder populations. Annals of Human Genetics, 64(3), 255-265.
Camp, N. (1997). Genomewide transmission/disequilibrium testing- consideration of the genotypic relative risks at disease loci. The American Journal of Human Genetics, 61(6), 1424-1430.
Falk, C. T., & Rubinstein, P. (1987). Haplotype relative risks: an easy reliable way to construct a proper control sample for risk calculations. Annals of Human Genetics, 51(3), 227-233.
Gibson, G., & Muse, S. V. (2002). A primer of Genome Science. MA: Sinauer Associates, INC.
Hershey, A. D., & Chase, M. (1952). Independent functions of viral protein and nucleic acid in growth of bacteriophage. The Journal of General Physiology, 36(1), 39-56.
Holmans, P. (1993). Asymptotic properties of affected-sib-pair linkage analysis. The American Journal of Human Genetics, 52(2), 362-374.
Li, C. C. (1996). Population genetics of coincidental DNA matches. Human Biology, 68(2), 167-184.
Martin, E. R., Monks, S. A., Warren, L. L., & Kaplan, N. L. (2000). A test for linkage and association in general pedigrees: the pedigree disequilibrium test. The American Journal of Human Genetics, 67(1), 146-154.
Martin, E. R., Bass, M. P., & Kaplan, N. L. (2001). Correcting for a potential bias in the pedigree disequilibrium test. The American Journal of Human Genetics, 68(4), 1065-1067.
McNemar, Q. (1947). Note on the sampling error of the difference between correlated proportions or percentages. Psychometrika, 12(2), 153-157.
Ott, J. (1989). Statistical properties of the haplotype relative risk. Genetic Epidemiology, 6(1), 127-130.
Schaid, D. J., McDonnell, S. K., Hebbring, S. J., Cunningham, J. M., & Thibodeau, S. N. (2005). Nonparametric tests of association of multiple genes with human disease. The American Journal of Human Genetics, 76(5), 780-793.
Spielman, R. S., McGinnis, R. E., & Ewens, W. J. (1993). Transmission test for linkage disequilibrium: the insulin gene region and insulin- dependent diabetes mellitus (IDDM). The American Journal of Human Genetics, 52(3), 506-516.
Tai, J. J., & Hou, C. D. (2006). On the combination of transmission /disequilibrium test and mean test for linkage detection using affected sib pairs. Computational Statistics & Data Analysis, 50, 1072-1089.
Wei, L. J., & Johnson, W. E. (1985). Combining dependent tests with incomplete repeated measurements. Biometrika, 72(2), 359-364.
Wicks, J., & Wilson, S. R. (2000). Evaluating linkage and linkage disequilibrium: use of excess sharing and transmission disequilibrium methods in affected sib pairs. Annals of Human Genetics, 64(5), 419-432.
Xu, X., Weiss, S., Xu, X., & Wei, L. J. (2000). A unified haseman-elston method for testing linkage with quantitative traits. The American Journal of Human Genetics, 67(4), 1025-1028.

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