智慧財產權之相關法規，原本只是一個國家的國內經濟法規的範圍，但隨著國際貿易的興盛，商品及服務產銷流動頻繁，導致商品及服務會跨越不同法律領域，因此，跨國間智慧財產權保護問題隨之而生，兩岸間亦不例外。
大陸從1970年代開始開放經濟改革，然而由於兩岸間特殊政治立場問題，一直到1990年才開始非官方的接觸，於1991年，兩岸各自成立海基會及海協會民間機構作為兩岸會談的對口單位，包含處理智慧財產權之爭議案件。但是僅透過兩岸兩會藉由個案協處的方式並無法全面提升兩岸的智慧財產權的保護合作。隨著兩岸經貿關係加深，智慧財產保護問題成為兩岸貿易交流上的一道難題。一直到2010年6月，在第五次江陳會談中，雙方簽訂「海峽兩岸經濟合作架構協議」(ECFA)，及「海峽兩岸智慧財產權保護合作協議」，兩岸在智慧財產合作保護上跨出歷史性的一大步。
本文將從兩岸智慧財產權，也就是專利、商標、著作權法的修法歷程介紹相關修法內容，藉由法制面的瞭解，進一步再探討兩岸間在智慧財產權方面的常見爭議問題，並以兩岸智慧財產權保護合作協議規範內容為主，討論相關因應措施，最後，由於ECFA簽訂之後，裡面的爭端解決機制提供兩岸紛爭解決另一個平台，本文將以國際經濟組織或區域自由貿易協定相關規範為借鏡，探討ECFA中爭端解決機制之制度設計。以上相關保護合作模式的內容，希望可以作為將來具體執行的參考。

The intellectual property rights（IPR） regulations are usually to be a portion of domestic economical regulations for many countries, due to the prosperity of the international trading business, commodities transactions and service business exchanges between different countries and regions has become constantly and frequently, the issue regarding transnational IPR protections also become more important than ever. This situation has been reflected on the bilateral relations between Taiwan and the mainland China as well.
The mainland China has implemented the economic reforming policy since 1970s, however, due to the particular political stand between cross-straits, the both sides did not begin any official or unofficial contact until 1991. In 1991, the both sides respectively found civil institutions of SEF（Straits Exchange Foundation） and ARATS（Association for Relations Across the Taiwan Straits） as the suitable unit to deal with the both sides affairs, including the IPR controversial cases. Nevertheless, solving some single case problems through this channel could not comprehensively enhance the IPR protecting cooperative function of the both sides. As the economic and trading relationship become deeper and deeper between cross-straits, the IPR protection issues have also become more difficult to deal with. Until June 2010, the both sides signed the “Cross-Straits Economic Cooperation Framework Agreement” (ECFA), and the “Cross-Straits Agreement on Intellectual Property Right Protection and Cooperation” in the fifth Chiang-Chen Meeting, Taiwan and China finally made a tremendous and historical progress on the IPR protecting cooperation ever.
This thesis will introduce the amended contents of both sides Patent Act, Trademark Act and Copyright Act through their regulatory histories. In addition, the thesis will discuss some IPR controversial issues usually happened between both sides, and try to find out some countermeasures making use of the content of “Cross-Straits Agreement on Intellectual Property Right Protection and Cooperation”. After Taiwan and China sign the ECFA, the dispute settlement mechanism in ECFA provides another platform to help solving disputes between both sides. This thesis will also take related rules from international economic organization and regional free trade agreement as a lesson to explore the design of dispute settlement mechanism in ECFA. Finally, we will propose some conclusions to be the advisory opinion for future execution.

第一章　緒論 1
第一節　研究動機 1
第二節　研究目的 3
第三節　研究範圍及方法 4
第一項 研究範圍 4
第二項 研究方法 5
第二章　臺灣智慧財產權法制之發展 6
第一節　專利法之發展 6
第一項 加入WTO前之修正 6
第二項 加入WTO後因應國際規範之修正 8
第三項 專利法最新修法進展 11
第二節　商標法之發展 13
第一項 加入WTO前之修正 13
第二項 加入WTO後因應國際規範之修正 15
第三項 商標法最新修法進展 18
第三節　著作權法之發展 19
第一項 加入WTO前之修正 19
第二項 加入WTO後因應國際規範之修正 20
第三項 著作權法最新修法進展 23
第四節　台灣與國際組織及成員間智慧財產權保護合作互動 24
第一項 與WTO的互動 24
第二項 與APEC的互動 27
第三項 與歐盟、美國及日本的互動 28
第三章　大陸智慧財產權法制之發展 34
第一節　專利法之發展 34
第一項 專利法第一次修正 34
第二項 專利法第二次修正 36
第三項 專利法第三次修正 37
第二節 商標法之發展 41
第一項 商標法第一次修正 41
第二項 商標法第二次修正 42
第三項 商標法最新修法進展 46
第三節 著作權法之發展 49
第一項 著作權法第一次修正 49
第二項 著作權法第二次修正 56
第三項 著作權法最新修法進展 57
第四節　大陸與國際組織及成員間智慧財產權保護合作互動 58
第一項 與WTO的互動 58
第二項 與WIPO的互動 60
第三項 與歐盟、美國及日本的互動 61
第四章　兩岸智慧財產權之常見爭議及交流與兩岸智慧財產權保護合作協議 67
第一節　兩岸智慧財產權之常見爭議 69
第一項 專利權部分 69
第二項 商標權部分 72
第三項 著作權部分 77
第二節　兩岸就智慧財產權保護之交流互動 79
第一項 政府推動兩岸交流合作的情形 79
第二項　民間組織間就兩岸智慧財產權之交流 81
第三節　兩岸智慧財產權保護合作協議 86
第一項 兩岸智慧財產權保護合作協議之規範重點 86
第二項 兩岸智慧財產權保護合作協議之相關議題及因應措施 90
第五章　兩岸經濟合作架構協議下智慧財產權之紛爭解決 100
第一節　兩岸經濟合作架構協議 100
第一項 兩岸經濟合作架構協議之國際法上定位 101
第二項 兩岸經濟合作架構協議內容 104
第二節　兩岸智慧財產權紛爭解決現況 113
第一項 WTO爭端解決機構及爭端解決程序 114
第二項 兩岸以WTO爭端解決機制解決智慧財產權紛爭之可行性 118
第三節　兩岸經濟合作架構協議爭端解決機制 120
第一項 國際區域經濟組織之爭端解決機制介紹 120
第二項 兩岸經濟合作架構協議爭端解決機制建議 125
第六章　結論及建議 130
第一節 結論 130
第二節 建議 132
參考文獻及書目 134

(依筆畫順序排列)
一、中文文獻：
(一)中文書籍：
1、于澤輝主編，知識產權戰略與實務，法律出版社，2008 年。
2、大陸國家知識產權局，專利審查指南（2010），北京：知識產權出版
社，2010 年。
3、吳漢東主編，知識產權法（第三版），北京：法律出版社，2009 年2
月。
4、李文賢，專利法要論，台北：翰蘆圖書出版，2005 年。
5、林彩瑜，WTO 貿易救濟與爭端解決之法律問題，台北：元照出版社，
2006 年。
6、陳櫻琴、葉玟妤，智慧財產權法，台北：五南出版社，2011 年3 月
三版。
7、許忠信，WTO 與貿易有關智慧財產權協定之研究，台北：元照出版
社，2005 年。
8、張乃根，WTO 爭端解決機制論－以TRIPS 協定為例，上海人民出版
社，2008 年。
9、張懿云，著作權法及相關案例介紹，台北：經濟部智慧財產局，2006
年。
10、彭思舟，兩岸商事法律戰略解碼站－兩岸智財權實用篇，台北：威
秀出版社，2007 年1 月。
11、馮震孙，智慧財產權發展趨勢與重要問題研究，台北：元照出版社，
2003 年。
12、馮震孙，國際智慧財產權公約及國際發展趨勢，台北：經濟部智慧
財產局，2006 年。
135
13、馮震孙，大陸入世後對智慧財產權之司法保護與行政保護，中國大
陸法制研究- 第十六輯，台北：司法院，2008 年1 月。
14、黃立、李貴英、林彩瑜，WTO 國際貿易法論，台北：元照出版社，
2009 年。
15、費安玲主編，新編高等教育知識產權法學系列教材－知識產權法教
程（第二版），國家知識產權局人事司組織編寫，北京：知識產權
出版社，2005 年8 月。
16、鄭忠人，智慧財產權法導讀，台北：五南出版社，2004 年。
17、劉春田，知識產權法，北京：中國人民大學出版社，2004 年。
18、劉江彬、陳美章主編，兩岸智慧財產權保護與運用，台北：元照出
版社，2002 年。
19、趙晉枚、蔡坤財、周慧芳、謝銘洋、張凱娜合著，智慧財產權入門，
台北：元照出版社，2005 年5 月。
20、蔡明誠，專利法，台北：經濟部智慧財產局，2009 年。
21、蕭雄淋，著作權法論，台北：五南出版社，2007 年。
22、謝銘洋，智慧財產權法導論，台北：經濟部智慧財產局，2006 年。
23、謝銘洋，智慧財產權法導論，智慧財產培訓學院教材，國立臺灣大
學科技整合法律研究所編印/經濟部智慧財產權指導，台北：經濟部
智慧財產局，2007 年。
24、鍾立國，內地與香港-更緊密經貿關係安排法律問題研究，北京：法
律出版社，2007 年7 月。
25、羅明通，著作權法論，台北：台英商務法律出版，2005 年。
26、羅昌發，自由貿易區協定對台灣與大陸、香港關係之意涵（張憲初
主編之「世貿規則與兩岸四地經貿法律關係」），香港：商務印書館
（香港）有限公司，2003 年。
136
27、羅昌發，國際貿易法，台北：元照出版社，2004 年
(二) 中文期刊及研究報告：
1、王美花、張瓊惠，論商標之淡化，商標法制與實務論文集，台北：
經濟部智慧財產局，2006 年6 月。
2、王琇慧，兩岸入世貿後智慧財產權爭議解決之探討，萬國法律，2002
年1 月。
3、王琇慧，世界貿易組織「智慧財產權爭端解決」之法律與政治策略
探討，智慧財產權月刊，第142 期，2010 年10 月。
4、王泰銓、劉家華，兩岸經濟合作架構協議（ECFA）之形式架構與實
質內容，月旦法學雜誌，第169 期，2009 年6 月。
5、王震孙，兩岸經濟合作架構協議之現狀與未來，月旦法學雜誌，第
189 期，2011 年2 月。
6、江國慶，國際貿易架構下之地理標示調和機制，科技法律透析，2008
年6 月。
7、余敏友、范相堯、李斯，ECFA 必不可少的制度安排-爭端解決機制，
月旦財經法雜誌，第21 期，2010 年6 月。
8、李明錦，台灣與大陸兩岸著作權集體管理法制之比較，智慧財產權
月刊，2006 年12 月。
9、李鎂，WTO 架構下兩岸智慧財產權保護制度，致理技術學院「新形
勢下的兩岸關係」學術研討會，2003 年10 月。
10、李貴敏、劉偉立，「專利制度之車轍同軌－由WIPO 專利整合計畫
與美日專利申請高速公路觀察全球專利制度整合趨勢與對台灣之可
能影響」，智慧財產權月刊，第103 期，2007 年7 月。
11、易建明、陳喬琳，NAFTA、日墨FTA 關於「爭端解決專章」
規範之比較研究:以適用範圍、仲裁程序為中心，世新法學，
137
2010 年6 月。
12、邱政宗，多邊貿易架構下之爭端解決機制，進口救濟論叢第三期，
1993 年12 月。
13、邱政宗，世界貿易組織爭端解決機制的現況與展望－上，立法院院
聞，第32 卷第1 期，2004 年。
12、林富傑，如何因應台灣名產商標遭大陸強註問題之研析，財團法人
國家政策研究基金會國正研究領域科技經濟組（國政分析），2006
年12 月。
13、林秋妙，兩岸經濟合作架構協議（ECFA）之國際法上定位與國會
監督之研究，法學新論，第16 期，2009 年11 月。
14、洪淑敏，兩岸商標制度之比較，智慧財產權月刊，2006 年12 月。
15、帥亞南，APEC 規範網路著作權侵權政策之發展及其對兩岸三地之
影響，月旦民商法第17 期，2007 年9 月。
16、陳清男主持；蔡坤財，賴文帄，盧信昌協同主持，臺灣廠商在大陸
智慧財產權保護問題調查與因應研究計畫期末報告，中華民國全國
全國工業總會，2008 年12 月。
17、章忠信，大陸新修改著作權法概述，智慧財產權月刊，2002 年2
月。
18、馮震孙，臺灣智慧財產權法制之發展與重要爭議問題探討，月旦民
商法雜誌第9 期，2005 年9 月。
19、陳郁庭，海峽兩岸智慧財產權保護合作協議之介紹與初評，科技法
律透析，2010 年11 月。
20、黃裕星，參加WTO/ TRIPS 理事會及APEC 農業生技研討會報告，
2004 年11 月，。
21、謝銘洋著，智慧財產權法—我國智慧財產權法近年來之發展與司法
138
實踐，台大法學論叢第39 卷第2 期，2010 年6 月，頁204。
22、韓秀麗，論兩岸經濟合作架構協定中的爭端解決機制問題，月旦財
經法雜誌，第21 期，2010 年6 月。
(三) 博碩士論文：
1、李悅菁著，我國在APEC 中的務實外交政策（1989-2001），國立臺
灣大學政治學研究所碩士論文，民國90 年。
2、李孟鎔著，兩岸經貿互動過程中WTO 爭端解決機制之研究，國立東
華大學公共行政研究所碩士論文，民國92 年。
3、吳中仁著，WTO 架構下中國大陸對馳名商標的特殊保護，臺灣大學
國家發展研究所碩士論文，民國94 年。
4、林祐辰著，雙邊自由貿易協定之法律體制—以東北亞國家為例，東
吳大學法律研究所碩士論文，民國94 年。
5、陳小坪著，WTO 架構下兩岸經貿互動之研究，國立臺灣師範大學政
治學研究所碩士論文，2009 年。
6、陳筱筠著，臺灣在WTO 爭端解決機制下處理兩岸經貿爭端研究，國
立政治大學外交研究所碩士論文，民國92 年。
7、陳筱蕾著，論世界貿易組織架構下建立兩岸貿易諮商與爭端解決機
制，東吳大學法律學系研究所碩士論文，民國91 年。
8、陳鈺盛著，中國大陸智慧財產權之制度改革與執行落差－以地方保
護主義之觀點，國立東華大學財經法律研究所碩士論文，2009 年1
月。
9、陳淑君著，多邊與雙邊FTA 模式對東亞的影響與研究，國立中山大
學大陸研究所碩士論文，民國96 年。
10、陳碧燕著，智慧財產權保護之國際爭端解決機制之研究，中國文化
大學法律學研究所碩士論文，民國91 年。
139
11、黃立維，中國大陸專利保護之研究－－以侵權救濟為中心，東吳大
學法律學系中國大陸法律碩士在職專班碩士論文，2006 年。
12、黃兆弘，智慧財產權國際爭端解決體系之研究─以WTO/TRIPS 爭
端解決機制為主，東吳大學法律研究所碩士論文，2007 年。
13、彭思舟著，中國知識產權法律保護制度之研究--從因應TRIPs 協定
之角度分析，中國文化大學中山學術研究所博士論文，2005 年。
14、趙麗君著，海峽兩岸智慧財產權相容及爭端解決方案之研究，東吳
大學法律學系碩士論文，2010 年。
（四）網站資料：
1、 http://big5.chinataiwan.org，中國臺灣網。
2、 http://china.findlaw.cn，找法網FindLaw.cn。
3、 http://www.bst.tw，貝斯特國際智權股份有公司。
4、 http://www.copyrightnote.org，著作權筆記。
5、 http://fta.mofcom.gov.cn，商務部中國自由貿易區服務網。
6、 http://hziplawyer.blog.bokee.net，浙江知識產權律師網。
7、 http://ip.people.com.cn，知識產權-人民網。
8、 http://jirs.judicial.gov.tw，司法院法學資料檢索系統。
9、 http://tech.chinatimes.com，中時電子報。
10、http://news.wenweipo.com，文匯網。
11、http://sbj.saic.gov.cn，大陸國家工商行政管理總局商標局。
12、http://twbusiness.nat.gov.tw，全球台商服務
13、http://www.chinalawinfo.com，北大法律信息網。
14、http://www.cipnews.com.cn，中國知識產權報。
15、http://www.cnfi.org.tw，全國工總服務網。
16、http://www.copyrightnote.org,，作權筆記。
17、http://www.court.gov.cn，大陸最高人民法院。
18、http://www.ecfa.org.tw，兩岸經濟合作架構協議專屬網站。
19、http://www.ftc.gov.tw,，行政院公帄交易委員會。
20、http://www.huaxia.com，華夏經緯網。
21、http://www.ipd.gov.hk,，香港知識產權署。
22、http://www.mac.gov.tw，行政院大陸委員會網頁。
23、http://www.moea.gov.tw，經濟部。
140
24、http://www.naipo.com.tw，北美智權股份有限公司。
25、http://www.ncac.gov.cn，大陸國家版權局。
26、http://www.npc.gov.cn，大陸全國人民大會中國人大網。
27、http://www.npf.org.tw，國家政策研究基金會。
28、http://www.seftb.org，海基會兩岸經貿網網頁。
29、http://www.sina.com.cn，新浪博客。
30、http://www.sipo.gov.cn，大陸國家知識產權局。
31、http://www.ssn.com.tw，兩岸經貿服務網。
32、http://www.tcoc.org.tw，台灣商會聯合資訊網。
33、http://www.tid.gov.hk，香港工業貿易署。
34、http://www.tipo.gov.tw，經濟部智慧財產局。
35、http://www.trade.gov.tw，經濟部國際貿易局。
36、http://twbusiness.nat.gov.tw，全球臺商服務網。
37、http://www.unn.com.cn，地方-人民網。
二、外文資料：
A. Documents of International Organizations
1. Trade Policy Review, Separate customs Territory of Taiwan, Penghu,
Kinmen and Matsu （Chinese Taipei）, Minutes of Meeting （Revision）,
WT/TPR/M/165/Rev.1, 10 October 2006.
B.WEBSITES
1. http://europa.eu, European Union.
2. http://oami.europa.eu, The Trade Marks and Designs Registration Office
of the European Union （OHIM）.
3. http://scholar.google.com, Google Scholar.
4. http://web.lexis-nexis.com, LexisNexis.
5. http://www.aippi.org, International Association for the Protection of
Intellectual Property.
6. http://www.epo.org, European Patent Office.
7. http://www.eusa-taiwan.org, European Union Study
Association-Taiwan.
141
8. http://www.findlaw.com, FindLaw.
9. http://www.ftc.gov, U. S. Federal Trade Commission.
10. http://www.naftanow.org, North American Free Trade Agreement.
11. http://www.uncitral.org, United Nations Commission on International
Trade Law.
12. http://www.usdoj.gov, U. S. Department of Justice.
13. http://www.uspto.gov, U. S. Patent and Trademark Office.
14. http://www.westlaw.com, Westlaw.
15. http://www.wipo.int, World Intellectual Property Organization.
16. http://www.wto.org, World Trade Organization.