徵引書目：
一、史料
（一）中文
《明清史料乙編》「兵部題行『條陳彭湖善後事宜』殘稿」
文 儀，《續修台灣府志》，臺北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
王必昌總輯、王志眉點校，《重修臺灣縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
王瑛曾，《重修鳳山縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
王禮修、王志眉點校，《臺灣縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
江日昇，《台灣外記》，福建：福建人民出版社，1983年。
梅村野史，《鹿樵紀聞》南投：國史館南投文獻館，1995年。
沈國元，《兩朝從信録》，卷十九。
沈 鈇，〈上南撫臺移檄暹羅宣喻紅裔書〉，收入《詔安縣志》，卷12。
沈 鈇，〈上南撫臺經營彭湖六策書〉，收入《詔安縣志》，卷12。
谷應泰，〈鄭芝龍受撫〉，《明史記事本末》卷七十六。
周凱，《厦門志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
周碩勛，《潮州府志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
周鍾瑄修、詹雅能點校，《諸羅縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
周 璽，《彰化縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
林學增，《同安縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
施 琅，《靖海紀事》，臺北：臺灣銀行經濟研究室，1958年。
查繼佐，《罪惟錄選輯》南投：國史館臺灣文獻館，1997年。
范咸纂，陳偉智點校《重修臺灣府志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
孫承澤，《春明夢餘錄》，臺北：新興書局，1989年。
徐景熹，《福州府志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
高拱乾纂、周元文修，《臺灣府志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
張廷玉等撰，《明史列傳》，台北：明文書局，1991年。
張 燮，《東西洋考》，北京：中華書局，1981年初版。
曹履泰，《靖海記略》，臺北：臺灣銀行經濟研究室，1959年。
清（永瑢）編，《四庫全書總目》，海口：海南出版社，1999年。
連 橫，《臺灣通史》，台北：台銀經濟研究室，1962年版。
陳一堃，《連城縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
陳仁錫，《無夢園初集》，上海：上海古籍出版社，1633年。
陳文達著，王禮修、王志眉點校，《臺灣縣志》，臺北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
陳 鍈，《海澄縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
陳 鍈，《海澄縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
黃宗羲，《賜姓始末》，南投：臺灣省文獻委員會，1995年。
廈門大學台灣研究所中國第一歷史檔案館，《康熙統一台灣檔案史料選輯》，福州：福建人民出版社，1983年。
楊 浚，《淡水廳志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
溫睿臨，《南疆繹史》，臺北：大通書局，1987年。
齊 翀，《（乾隆）南澳志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
劉獻廷，《廣陽雜記》，北京：中華書局，1957年。
談 遷，《棗林雜俎》，北京：中華書局，2006年。
謝金鑾，《續修臺灣縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
周鍾瑄修、詹雅能點校，《諸羅縣志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
懷蔭布，《泉州府志》，台北：行政院文化建設委員會、遠流出版社，2005年。
（二）日文
村上直次郎譯著、中村孝志校著，《巴達維亞城日誌》，東京：平凡社，1970年。
東京大學史料編纂所，《日本關係海外史料･イギリス商館日記譯文編之上、中、下》，日本：東京大學出版會，1978年。
（三）西文
C. R. Boxer, The Christian Century in Japan, 1549-1650.university of California press ,Berkeley, London,1951.
J. Borao, Spaniards in Taiwan, vol.
江樹生、翁佳音等譯，《荷蘭聯合東印度公司臺灣長官致巴達維亞總督書信集Ⅰ(1622-1626) 》，南投：國史館臺灣文獻館，2011年。
東京大學史料編纂所，《日本關係海外史料･イギリス商館日記原文編之上、中、下》，日本：東京大學出版會，1978年。
二、專書
（一）中文
中村孝志，《荷蘭時代台灣史研究 上卷》，臺北：稻鄉出版社，1998年。
王慕民，《海禁抑商與嘉靖「倭亂」－明代浙江私人海外貿易的興衰》，北京：海洋出版社，2011年。
江樹生〈梅花鹿與臺灣早期始關係之研究 上〉《臺灣梅花鹿復育之研究七十三年度報告》，內政部營建署墾丁國家公園管理處，1985年。
江仁傑，《解構鄭成功—英雄神話與形象的歷史》，臺北：三民出版社，2006年。
呂自揚，《打狗 阿猴 林道乾：尋找高雄平埔族的身影》，高雄：河畔出版社，2014年。
李若文，《海賊王蔡牽的世界》，台北：稻鄉出版社，2011年。
松浦章著、卞鳳奎譯，《東亞海域與臺灣的海盜》，台北：柏楊文化出版有限公司，2008年。
林仁川，《明末清初私人海上貿易》，上海：華東師範大學出版社，1987年。
晁中辰，《明代海禁與海外貿易》，北京：人民出版社，2005年。
曹永和，《臺灣早期歷史研究》，臺北市：聯經出版社，1979年。
陳佳榮、謝方等人著，《古代南海地名匯釋》，北京：中華書局，1986年初版。
陳尚勝，《「懷夷」與「抑商」：明代海洋力量興衰研究》，山東：山東人民出版社，1997年。
黃阿有，《嘉義的地方傳說與考證》，台北：稻鄉出版社，2011年。
鄭永常，《海禁的轉折：明初東亞沿海國際形勢與鄭和下西洋》，台北：稻鄉出版社，2011年。
（二）日文
松浦章，《中国の海賊》，東京：東方書店，1995年。
福住信邦，《新国姓爺合戦物語り「下」》，東京：講談社サービスセンター，1992年。
下中邦彥，《アジア歴史事典》（東京：平凡社，1960年。
（三）西文部
Satow, E. M., The voyage of Captain John Saris to Japon, 1613. London. 1900.
三、期刊論文
（一）中文部
毛一波，〈李旦問題的檢討〉《台灣風物》，13：2，臺北：1963，頁3-7。
白鳥庫吉，〈中國古傳說之研究〉《日本學者研究中國史論著選譯》，北京：中華書局，1992年。
吳大昕，〈海商、海盜、倭――明代嘉靖大倭寇的形象〉，南投：暨南國際大學歷史學研究所，2002年。
宋夢琪，〈流動的界線：金門人物的傳說與史料的關係〉，金門：國立金門大學閩南文化研究所，2015年。
李明仁，〈另類的繼承，以明鄭海上利益集團之更迭為例〉《史原》21，臺北：1999.02，頁1-39。阮忠仁，〈顏、鄭渡臺設「十寨」傳說之演化－《臺灣割據志》的十寨敘事〉，《嘉義研究》，第八期（嘉義：國立嘉義大學人文藝術學院台灣文化研究中心，2013)，頁132-158。阮忠仁，〈顏、鄭渡臺設「十寨」傳說之演化–以《靖海志》的十寨敘事〉，《嘉義研究》第四期，嘉義：國立嘉義大學人文藝術學院台灣文化研究中心，2011年，115-194。林永村，〈笨港聚落的形成與媽祖信仰重鎮的確立〉《台灣文獻》42：2，台中：1991初版，頁333-342。
翁佳音，〈十七世紀福佬海商〉，收於《中國海洋發展史論文集第七輯上冊》台北：中研院中山人文社會科學研究所，頁59-92。
曹永和，〈環アジア海域交流史における臺灣と日本〉，收於箭內健次編，《鎖國日本と國際交流》，東京：吉川弘文館，1998年，頁611-639。
許賢瑤譯、岩生成一著，〈明末僑寓日本支那人甲必丹考〉，收錄自《荷蘭時代台灣史論文集》，宜蘭：佛光人文社會學院，2001年，頁59-130。
陳正祥，〈三百年來臺灣地理之變遷〉，《臺灣文獻》，12：1，南投，1961，67-92。
陳國棟，〈馬尼拉大屠殺與李旦出走日本的一個推測（1603~1607）〉《臺灣文獻》， 60：3，南投：2009.09，頁33-62。湯開健，〈劉堯誨《督撫疏議》中保存的林鳳及其與西班牙關係史料〉，澳門：明清時期的中國與西班牙國際學術研討會論文匯編，2007，頁29-38。
黃典權，《顏思齊考索的試論》《臺灣風物》，23：3，臺北：1973.09。黃阿有，〈顏思齊鄭芝龍入墾臺灣研究〉，《臺灣文獻》54：4，南投：2003.12，頁93-122。黃阿有，〈顏思齊鄭芝龍入墾臺灣研究〉《臺灣文獻》54：4，南投：2003.12，頁93-122。廖漢臣，〈鄭芝龍考（下）〉，《臺灣文獻》，11：3，南投：1960。
趙元良，〈鄭芝龍與十七世紀的東亞國際貿易〉，台中：國立中興大學碩士在職論文，2012年。鄭喜夫，〈李旦與顏思齊〉，《臺灣風物》，18：1（1968），頁24-36。鄭喜夫，〈補記「李旦與顏思齊」，《臺灣風物》，19：臺北：1969，頁59-64。盧正桓，〈官與賊之間：鄭芝龍霸權及「鄭部」〉，新竹：國立清華大學碩士論文，2012年。
盧嘉興，〈蚊港與青峰闕考〉，《台南文化》7：2，台南：1961.06，頁110-122。
賴永祥，〈戰後日本對鄭氏的研究〉，《新時代》，1：4，臺北：1961.04，頁24-157。
蘇信維，〈閩浙地區海盜集團之研究－以蔡牽集團為例（1795-1810）〉，台南：成功大學歷史學研究所，2008年。
（二）日文部
中村孝志，〈台灣史概要近代篇〉，《民族學研究》，18：1-2，臺北：1954，頁113-122。
岩生成一，〈明末日本僑寓支那甲必丹李旦考〉，《東洋學報》，23：3（1936），63-119。