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臺灣博碩士論文加值系統

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研究生:金繼昭
研究生(外文):King, Ji-Jao
論文名稱:以色彩分圖法於個人電腦上呈現生物分子之立體構造
論文名稱(外文):Virtual Visualization of Biomolecules with Chromatic Anaglyph in Personal Computer
指導教授:高振益高振益引用關係
指導教授(外文):JungYie Kao
學位類別:碩士
校院名稱:國立中興大學
系所名稱:分子生物研究所
學門:生命科學學門
學類:生物科技學類
論文種類:學術論文
論文出版年:1996
畢業學年度:85
語文別:中文
論文頁數:2
中文關鍵詞:視覺化計算機圖學生物巨分子色彩分圖
外文關鍵詞:VisualizationComputer GraphicsMacrobiomoleculesChromatic Anaglyph
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在分子生物以及生物化學廣大的範疇中,一項頗為重要的課題便是研
究生物組成分子構造與功能間的相關性。由於生物分子非常的複雜,不論
研究與觀察均相當不易,利用圖形的展現,將可以方便研究人員﹑教師以
及學生進行研究﹑教學﹑學習以及表達展示。 運用計算機圖學(
computer graphics )技術,我們可以將生物分子視覺化,以三維圖形表
示方式顯示生物分子於電腦螢幕上供使用者觀察。 為了達到此一目的,
首先必須獲得生物分子構造的相關資料,另外還需要能將這些資料視覺化
的電腦軟硬體設備。 蛋白質資料庫( protein data bank, PDB
)是一個利用電腦存取檔案為基礎所建立之生物巨分子( macro
biomolecules )結構及相關資料的資料庫, 此資料庫並提供網際網路(
Internet )檢索服務, 利用檔案傳輸功能可以方便的將檢索獲得資
料下載(download )以利進一步的分析。

本研究便是利用蛋白質資料庫格式檔案( PDB file )做為資料來源製
作一套可以呈現生物巨分子的應用軟體。 此軟體是以 Visual Basic 語
言撰寫而成,為一套可使用於個人家用電腦,以 Windows 3.X ﹑Windows
95 ﹑Windows NT 為作業平台的公用軟體,本軟體以親和力較高之圖形使
用者介面( graphical user interface, GUI )為操作環境,使用者藉
由滑鼠操作可以進行圖形縮放、移動以及沿著 X,Y,Z 軸旋轉等功能。
本應用軟體主要功能在於讀取蛋白質資料庫格式 (Protein Data Bank
format) 檔案並將其轉換為三維結構模型, 以達到生物分子視覺化的效
果;另外再配合色彩分圖法(chromatic anaglyphic method),將分子模
型以立體視覺的方式呈現。使用者可配戴立體眼鏡藉此軟體輔助觀察生物
分子之立體構形並對其進行初步結構分析。

The relationship of macro biomolecular structure and
function is veryimportant in the biological and
biochemical system. Because of macrobiomolecular
complexity, it is difficult to observe and analyze their
threedimension conformations and quaternary structures. In
order to solve theseproblems, we can use picture presentation
to study and compare the structuresof macro biomolecules such
as proteins and nucleic acids. The Protein
Data Bank (PDB) archive of the Brookhaven National Laboratory(
BNL) is a computer-based archival file for macromolecular
structures. The Bankstores in a uniform format atomic
coordinates and partial bond connectivities,as derived from
crystallographic and NMR studies. For a number of years,
thePDB has been available on the internet for access via
FTP, more recentlythrough Gopher, and now via WWW. These tools
provided access to the individualentries of PDB and allowed
limited searches of the data bank. We develop a
personal computer based program which can read in
molecularcoordinate files in PDB formats and interactively
displays the molecule on themonitor screen. This program is
written in the Visual Basic language and usesthe Windows
graphics user interface. The Program can run on IBM PC
compatiblepersonal computers under Microsoft Windows 3.X,
Windows 95 and Windows NTsystems.

This program uses chromatic anaglyph method to display
stereo macrobiomolecular structures. Using this program,
each macro biomolecule can beviewed in three dimensional
model and can be moved, scaled and rotated aboutthree
orthogonal axes.

QRCODE
 
 
 
 
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
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