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幽門螺旋桿菌分泌出來的液胞毒素(簡稱VacA)會直接使寄主細胞產生空 泡化並造成細胞傷亡。與VacA強烈相關的毒素因子CagA也被發現與寄主細 胞IL-8的分泌有關。在歐美國家的分析中發現約有六成具有cagA基因,而 vacA則被發現具有很高的鑲嵌變異性(mosaicism)。利用PCR分析173個從 台灣分離出來的幽門螺旋桿菌之cagA,發現98%帶有此基因。利用 Atherton的方法發現119個台灣菌種的vacA signal peptide皆為s1a型, 而mid-region則大部分為m2型(≧80 %),約二成則為類似m1的m1T型(>87% identity),以及二株m1Tm2混合型。分析台灣菌種與vacA中間0.73-kb區 域的核酸序列,發現台灣的m2菌種與國外的m2菌種(Tx30a)頗為雷同(96 % identity),而m1T菌種則特別與日本某些m1型極為類似( >97 % identity)。s1a/m1T型的戴菌者比s1a/m2型更容易有腸胃潰瘍的現象 ( p< 0.05)。總計在台灣有s1a/m1T, s1a/m2, s1a/m1Tm2這三種組合。利用 限制片段長度多樣性(RFLP)的方法,分析台灣89個幽門螺旋桿菌的基因變 異性,發現2.0-kb的vacA聚合脢連鎖反應片段以HaeIII限制脢處理的結果 共有28種不同的類型。進一步分析其urease基因,發現2.4-kb的ureA- ureB聚合脢連鎖反應片段又可再細分出19種HaeIII限制片段長度多樣性, 且其中13種未曾見於西方文獻中。vacA每種RFLP類型都可對應特定的中間 區域之基因型( m1T, m2, m1Tm2),表示利用限制片段長度多樣性分類法 可以彌補原本PCR分類法的不足並且vacA不同的限制片段長度多樣性可能 提供與毒性高低或臨床致病性相關的線索。
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